Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Kelly Dorgan",
2
  "author": "Kelly Dorgan",
            
3
  "author_email": "kdorgan@disl.org",
3
  "author_email": "kdorgan@disl.org",
            
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
            
5
  "extras": [
5
  "extras": [
            
6
    {
6
    {
            
7
      "key": "DOI",
7
      "key": "DOI",
            
8
      "value": "doi:10.7266/N7RV0KS6"
8
      "value": "doi:10.7266/N7RV0KS6"
            
9
    },
9
    },
            
10
    {
10
    {
            
11
      "key": "ISO.principalInvestigator",
11
      "key": "ISO.principalInvestigator",
            
12
      "value": "Kelly Dorgan <kdorgan@disl.org>"
12
      "value": "Kelly Dorgan <kdorgan@disl.org>"
            
13
    },
13
    },
            
14
    {
14
    {
            
15
      "key": "Place Keywords",
15
      "key": "Place Keywords",
            
16
      "value": "Dauphin Island Sea Lab, DISL, Chandeleur Islands"
16
      "value": "Dauphin Island Sea Lab, DISL, Chandeleur Islands"
            
17
    },
17
    },
            
18
    {
18
    {
            
19
      "key": "Temporal Begin",
19
      "key": "Temporal Begin",
            
20
      "value": "2015-06-29"
20
      "value": "2015-06-29"
            
21
    },
21
    },
            
22
    {
22
    {
            
23
      "key": "Temporal End",
23
      "key": "Temporal End",
            
24
      "value": "2016-09-18"
24
      "value": "2016-09-18"
            
25
    },
25
    },
            
26
    {
26
    {
            
27
      "key": "Theme Keywords",
27
      "key": "Theme Keywords",
            
28
      "value": "seagrass, macroinfauna, abundance, functional group"
28
      "value": "seagrass, macroinfauna, abundance, functional group"
            
29
    },
29
    },
            
30
    {
30
    {
            
31
      "key": "spatial",
31
      "key": "spatial",
            
32
      "value": "{ \"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [ [ [ 
32
      "value": "{ \"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [ [ [ 
            
33
-88.84244, 29.93338 ], [ -88.82815, 29.93338 ], [ -88.82815, 29.86404 
33
-88.84244, 29.93338 ], [ -88.82815, 29.93338 ], [ -88.82815, 29.86404 
            
34
], [ -88.84244, 29.86404 ], [ -88.84244, 29.93338 ] ] ] }"
34
], [ -88.84244, 29.86404 ], [ -88.84244, 29.93338 ] ] ] }"
            
35
    }
35
    }
            
36
  ],
36
  ],
            
37
  "groups": [],
37
  "groups": [],
            
38
  "id": "7a2b626f-d536-4d88-aae4-07cb24db81bd",
38
  "id": "7a2b626f-d536-4d88-aae4-07cb24db81bd",
            
39
  "isopen": false,
39
  "isopen": false,
            
40
  "license_id": null,
40
  "license_id": null,
            
41
  "license_title": null,
41
  "license_title": null,
            
42
  "maintainer": "data@disl.org",
42
  "maintainer": "data@disl.org",
            
43
  "maintainer_email": "data@disl.org",
43
  "maintainer_email": "data@disl.org",
            
44
  "metadata_created": "2022-07-27T14:33:08.065887",
44
  "metadata_created": "2022-07-27T14:33:08.065887",
            
n
45
  "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:09.105348",
n
45
  "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:09.599613",
            
46
  "name": 
46
  "name": 
            
47
nalysis-in-shallow-water-habitats-around-the-chandeleur-islan7rv0ks6",
47
nalysis-in-shallow-water-habitats-around-the-chandeleur-islan7rv0ks6",
            
48
  "notes": "### Abstract\nAbundance measurements of benthic 
48
  "notes": "### Abstract\nAbundance measurements of benthic 
            
49
macroinfauna were measured in conjunction with field-deployed sediment 
49
macroinfauna were measured in conjunction with field-deployed sediment 
            
50
oxygen demand chambers at four sites on the Chandeleur Sound side of 
50
oxygen demand chambers at four sites on the Chandeleur Sound side of 
            
51
the Chandeleur Islands in the Fall and Summer of 2015 and 2016. Cores 
51
the Chandeleur Islands in the Fall and Summer of 2015 and 2016. Cores 
            
52
(15 cm diameter, 15 cm depth) were collected after each sediment 
52
(15 cm diameter, 15 cm depth) were collected after each sediment 
            
53
oxygen demand measurement was completed in the field, and additional 
53
oxygen demand measurement was completed in the field, and additional 
            
54
cores were collected for infauna only (with no SOD measurement; either 
54
cores were collected for infauna only (with no SOD measurement; either 
            
55
10 or 15 cm diameter; 15 cm depth). Each sediment core was sieved 
55
10 or 15 cm diameter; 15 cm depth). Each sediment core was sieved 
            
56
using 0.5 mm mesh. Each sample was preserved in 95% ethanol and Rose 
56
using 0.5 mm mesh. Each sample was preserved in 95% ethanol and Rose 
            
57
Bengal stain. All organisms that were alive upon collection and 
57
Bengal stain. All organisms that were alive upon collection and 
            
58
therefor stained were picked out using a dissecting microscope, and 
58
therefor stained were picked out using a dissecting microscope, and 
            
59
placed into separate vials with 95% ethanol for preservation. Animals 
59
placed into separate vials with 95% ethanol for preservation. Animals 
            
60
were identified to lowest taxonomic classification possible, and 
60
were identified to lowest taxonomic classification possible, and 
            
61
abundance and was calculated. Abundance was also calculated for taxa 
61
abundance and was calculated. Abundance was also calculated for taxa 
            
62
grouped into functional groups (motile carnivorous polychaetes, motile 
62
grouped into functional groups (motile carnivorous polychaetes, motile 
            
63
subsurface deposit feeding polychaetes, sessile surface deposit 
63
subsurface deposit feeding polychaetes, sessile surface deposit 
            
64
feeding polychaetes, motile omnivorous polychaetes, large discretely 
64
feeding polychaetes, motile omnivorous polychaetes, large discretely 
            
65
motile subsurface deposit feeding polychaetes, tube-dwelling 
65
motile subsurface deposit feeding polychaetes, tube-dwelling 
            
66
subsurface deposit feeding polychaetes, tube-dwelling omnivorous 
66
subsurface deposit feeding polychaetes, tube-dwelling omnivorous 
            
67
polychaetes, sessile suspension feeding polychaetes, crabs, amphipods 
67
polychaetes, sessile suspension feeding polychaetes, crabs, amphipods 
            
68
and isopods, burrowing crustaceans, non-burrowing shrimp, surface 
68
and isopods, burrowing crustaceans, non-burrowing shrimp, surface 
            
69
deposit feeding bivalves, motile suspension feeding bivalves, sessile 
69
deposit feeding bivalves, motile suspension feeding bivalves, sessile 
            
70
subsurface deposit feeding molluscs, snails, brittle stars, sea 
70
subsurface deposit feeding molluscs, snails, brittle stars, sea 
            
71
cucumbers, and others). These functional groups were based on size 
71
cucumbers, and others). These functional groups were based on size 
            
72
(interstitial, small, medium, or large), habitat (pelagic, epifaunal, 
72
(interstitial, small, medium, or large), habitat (pelagic, epifaunal, 
            
73
infaunal, or symbiotic), motility (motile, discretely motile, or 
73
infaunal, or symbiotic), motility (motile, discretely motile, or 
            
74
sessile), feeding (micro-suspension, micro-surface deposit, 
74
sessile), feeding (micro-suspension, micro-surface deposit, 
            
75
micro-subsurface deposit, funnel feeder, macro-herbivore, 
75
micro-subsurface deposit, funnel feeder, macro-herbivore, 
            
76
macro-carnivore, omnivore, osmotroph, parasitic, or alternates), and 
76
macro-carnivore, omnivore, osmotroph, parasitic, or alternates), and 
            
77
food delivery (tentacles-palps-tubefeet, mucus net, muscular eversible 
77
food delivery (tentacles-palps-tubefeet, mucus net, muscular eversible 
            
78
pharynx, non-muscular eversible pharynx, ramified or lamellar 
78
pharynx, non-muscular eversible pharynx, ramified or lamellar 
            
79
surfaces, other, siphonate, asiphonate, claws, filtering, or radula). 
79
surfaces, other, siphonate, asiphonate, claws, filtering, or radula). 
            
80
This grouping allowed for clearer interpretation of sediment oxygen 
80
This grouping allowed for clearer interpretation of sediment oxygen 
            
81
demand data. These data are associated with the datasets: Sediment 
81
demand data. These data are associated with the datasets: Sediment 
            
82
oxygen demand in shallow water habitats around the Chandeleur Islands 
82
oxygen demand in shallow water habitats around the Chandeleur Islands 
            
83
in 2015 and 2016 and Macroinfaunal abundance in shallow water habitats 
83
in 2015 and 2016 and Macroinfaunal abundance in shallow water habitats 
            
84
around the Chandeleur Islands in 2015 and 2016.\n\n### 
84
around the Chandeleur Islands in 2015 and 2016.\n\n### 
            
85
Purpose\nInfaunal samples were collected from oiled and unoiled sites 
85
Purpose\nInfaunal samples were collected from oiled and unoiled sites 
            
86
in seagrass (Ruppia and Thalassia) and open sediment habitats to 
86
in seagrass (Ruppia and Thalassia) and open sediment habitats to 
            
87
determine whether infaunal community structure had recovered from oil 
87
determine whether infaunal community structure had recovered from oil 
            
88
exposure during the Deepwater Horizon spill. Metrics of diversity and 
88
exposure during the Deepwater Horizon spill. Metrics of diversity and 
            
89
NMDS analysis were conducted to determine whether communities differed 
89
NMDS analysis were conducted to determine whether communities differed 
            
90
significantly between heavily and lightly oiled sites as well as among 
90
significantly between heavily and lightly oiled sites as well as among 
            
91
habitats. These data were collected as part of the ACER 
91
habitats. These data were collected as part of the ACER 
            
92
consortium.\n\n**DOI: 
92
consortium.\n\n**DOI: 
            
93
[doi:10.7266/N7RV0KS6](https://www.doi.org/10.7266/N7RV0KS6)**\n\n### 
93
[doi:10.7266/N7RV0KS6](https://www.doi.org/10.7266/N7RV0KS6)**\n\n### 
            
94
Suggested Citation\nKelly Dorgan, Sarah Berke. 2017. Macroinfaunal 
94
Suggested Citation\nKelly Dorgan, Sarah Berke. 2017. Macroinfaunal 
            
95
functional group analysis in shallow water habitats around the 
95
functional group analysis in shallow water habitats around the 
            
96
Chandeleur Islands in 2015 and 2016. Distributed by: Gulf of Mexico 
96
Chandeleur Islands in 2015 and 2016. Distributed by: Gulf of Mexico 
            
97
Research Initiative Information and Data Cooperative (GRIIDC), Harte 
97
Research Initiative Information and Data Cooperative (GRIIDC), Harte 
            
98
Research Institute, Texas A&M University\u2013Corpus Christi. 
98
Research Institute, Texas A&M University\u2013Corpus Christi. 
            
99
doi:10.7266/N7RV0KS6\n\n**Funded by:** Gulf of Mexico Research 
99
doi:10.7266/N7RV0KS6\n\n**Funded by:** Gulf of Mexico Research 
            
100
Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** RFP-IV\n\n**Research group:** 
100
Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** RFP-IV\n\n**Research group:** 
            
101
Alabama Center for Ecological Resilience (ACER)\n\n",
101
Alabama Center for Ecological Resilience (ACER)\n\n",
            
n
102
  "num_resources": 2,
n
102
  "num_resources": 3,
            
103
  "num_tags": 7,
103
  "num_tags": 7,
            
104
  "organization": {
104
  "organization": {
            
105
    "approval_status": "approved",
105
    "approval_status": "approved",
            
106
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
106
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
            
107
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
107
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
            
108
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
108
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
109
    "image_url": "",
109
    "image_url": "",
            
110
    "is_organization": true,
110
    "is_organization": true,
            
111
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
111
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
            
112
    "state": "active",
112
    "state": "active",
            
113
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
113
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
            
114
    "type": "organization"
114
    "type": "organization"
            
115
  },
115
  },
            
116
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
116
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
117
  "private": false,
117
  "private": false,
            
118
  "relationships_as_object": [],
118
  "relationships_as_object": [],
            
119
  "relationships_as_subject": [],
119
  "relationships_as_subject": [],
            
120
  "resources": [
120
  "resources": [
            
121
    {
121
    {
            
122
      "cache_last_updated": null,
122
      "cache_last_updated": null,
            
123
      "cache_url": null,
123
      "cache_url": null,
            
124
      "created": "2022-07-27T14:33:08.653208",
124
      "created": "2022-07-27T14:33:08.653208",
            
125
      "datastore_active": false,
125
      "datastore_active": false,
            
126
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
126
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
127
      "description": null,
127
      "description": null,
            
128
      "format": "XML",
128
      "format": "XML",
            
129
      "hash": "",
129
      "hash": "",
            
130
      "id": "d8a8c0ae-ed8c-41fa-ba0e-b52ae3b66222",
130
      "id": "d8a8c0ae-ed8c-41fa-ba0e-b52ae3b66222",
            
131
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:08.607302",
131
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:08.607302",
            
132
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:09.110250",
132
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:09.110250",
            
133
      "mimetype": "application/xml",
133
      "mimetype": "application/xml",
            
134
      "mimetype_inner": null,
134
      "mimetype_inner": null,
            
135
      "name": "R4.x262.000-0011-metadata.xml",
135
      "name": "R4.x262.000-0011-metadata.xml",
            
136
      "package_id": "7a2b626f-d536-4d88-aae4-07cb24db81bd",
136
      "package_id": "7a2b626f-d536-4d88-aae4-07cb24db81bd",
            
137
      "position": 0,
137
      "position": 0,
            
138
      "resource_type": null,
138
      "resource_type": null,
            
139
      "size": 32712,
139
      "size": 32712,
            
140
      "state": "active",
140
      "state": "active",
            
141
      "url": 
141
      "url": 
            
142
e-ed8c-41fa-ba0e-b52ae3b66222/download/r4.x262.000-0011-metadata.xml",
142
e-ed8c-41fa-ba0e-b52ae3b66222/download/r4.x262.000-0011-metadata.xml",
            
143
      "url_type": "upload"
143
      "url_type": "upload"
            
144
    },
144
    },
            
145
    {
145
    {
            
146
      "cache_last_updated": null,
146
      "cache_last_updated": null,
            
147
      "cache_url": null,
147
      "cache_url": null,
            
148
      "created": "2022-07-27T14:33:09.135512",
148
      "created": "2022-07-27T14:33:09.135512",
            
149
      "datastore_active": false,
149
      "datastore_active": false,
            
150
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
150
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
151
      "description": null,
151
      "description": null,
            
152
      "format": "CSV",
152
      "format": "CSV",
            
153
      "hash": "",
153
      "hash": "",
            
154
      "id": "f1ff0337-1843-441a-a017-5a84b3d1d410",
154
      "id": "f1ff0337-1843-441a-a017-5a84b3d1d410",
            
155
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:09.095330",
155
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:09.095330",
            
n
156
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:09.110578",
n
156
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:09.605687",
            
157
      "mimetype": "text/csv",
157
      "mimetype": "text/csv",
            
158
      "mimetype_inner": null,
158
      "mimetype_inner": null,
            
159
      "name": 
159
      "name": 
            
160
"Dorgan_Infauna_FunctionalGroups_CoreID_ACER_2015_2016.csv",
160
"Dorgan_Infauna_FunctionalGroups_CoreID_ACER_2015_2016.csv",
            
161
      "package_id": "7a2b626f-d536-4d88-aae4-07cb24db81bd",
161
      "package_id": "7a2b626f-d536-4d88-aae4-07cb24db81bd",
            
162
      "position": 1,
162
      "position": 1,
            
163
      "resource_type": null,
163
      "resource_type": null,
            
164
      "size": 29493,
164
      "size": 29493,
            
165
      "state": "active",
165
      "state": "active",
            
166
      "url": 
166
      "url": 
            
167
0/download/dorgan_infauna_functionalgroups_coreid_acer_2015_2016.csv",
167
0/download/dorgan_infauna_functionalgroups_coreid_acer_2015_2016.csv",
            
168
      "url_type": "upload"
168
      "url_type": "upload"
            
t
t
169
    },
            
170
    {
            
171
      "cache_last_updated": null,
            
172
      "cache_url": null,
            
173
      "created": "2022-07-27T14:33:09.636133",
            
174
      "datastore_active": false,
            
175
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
176
      "description": null,
            
177
      "format": "CSV",
            
178
      "hash": "",
            
179
      "id": "ba39a851-24f1-41c0-8680-468d08b76c62",
            
180
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:09.585138",
            
181
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:09.606086",
            
182
      "mimetype": "text/csv",
            
183
      "mimetype_inner": null,
            
184
      "name": "DORGAN_Functional_Abundancev2_ACER_2015_2016.csv",
            
185
      "package_id": "7a2b626f-d536-4d88-aae4-07cb24db81bd",
            
186
      "position": 2,
            
187
      "resource_type": null,
            
188
      "size": 43516,
            
189
      "state": "active",
            
190
      "url": 
            
191
8d08b76c62/download/dorgan_functional_abundancev2_acer_2015_2016.csv",
            
192
      "url_type": "upload"
            
169
    }
193
    }
            
170
  ],
194
  ],
            
171
  "state": "active",
195
  "state": "active",
            
172
  "tags": [
196
  "tags": [
            
173
    {
197
    {
            
174
      "display_name": "Chandeleur Islands",
198
      "display_name": "Chandeleur Islands",
            
175
      "id": "1187d400-d9de-4166-aca2-2e591ecf8c65",
199
      "id": "1187d400-d9de-4166-aca2-2e591ecf8c65",
            
176
      "name": "Chandeleur Islands",
200
      "name": "Chandeleur Islands",
            
177
      "state": "active",
201
      "state": "active",
            
178
      "vocabulary_id": null
202
      "vocabulary_id": null
            
179
    },
203
    },
            
180
    {
204
    {
            
181
      "display_name": "DISL",
205
      "display_name": "DISL",
            
182
      "id": "1e085581-f09f-4682-85b5-f165209bd558",
206
      "id": "1e085581-f09f-4682-85b5-f165209bd558",
            
183
      "name": "DISL",
207
      "name": "DISL",
            
184
      "state": "active",
208
      "state": "active",
            
185
      "vocabulary_id": null
209
      "vocabulary_id": null
            
186
    },
210
    },
            
187
    {
211
    {
            
188
      "display_name": "Dauphin Island Sea Lab",
212
      "display_name": "Dauphin Island Sea Lab",
            
189
      "id": "dc2cecea-f3b5-4b5d-8473-1cdd634903e0",
213
      "id": "dc2cecea-f3b5-4b5d-8473-1cdd634903e0",
            
190
      "name": "Dauphin Island Sea Lab",
214
      "name": "Dauphin Island Sea Lab",
            
191
      "state": "active",
215
      "state": "active",
            
192
      "vocabulary_id": null
216
      "vocabulary_id": null
            
193
    },
217
    },
            
194
    {
218
    {
            
195
      "display_name": "abundance",
219
      "display_name": "abundance",
            
196
      "id": "e78b3f21-7bf4-41ec-a631-1ec44b5a4a77",
220
      "id": "e78b3f21-7bf4-41ec-a631-1ec44b5a4a77",
            
197
      "name": "abundance",
221
      "name": "abundance",
            
198
      "state": "active",
222
      "state": "active",
            
199
      "vocabulary_id": null
223
      "vocabulary_id": null
            
200
    },
224
    },
            
201
    {
225
    {
            
202
      "display_name": "functional group",
226
      "display_name": "functional group",
            
203
      "id": "bbd9f183-f2af-46a9-a90b-fe2a5fe5651d",
227
      "id": "bbd9f183-f2af-46a9-a90b-fe2a5fe5651d",
            
204
      "name": "functional group",
228
      "name": "functional group",
            
205
      "state": "active",
229
      "state": "active",
            
206
      "vocabulary_id": null
230
      "vocabulary_id": null
            
207
    },
231
    },
            
208
    {
232
    {
            
209
      "display_name": "macroinfauna",
233
      "display_name": "macroinfauna",
            
210
      "id": "0de88826-2f06-4ea1-945d-88bc68dc3ef2",
234
      "id": "0de88826-2f06-4ea1-945d-88bc68dc3ef2",
            
211
      "name": "macroinfauna",
235
      "name": "macroinfauna",
            
212
      "state": "active",
236
      "state": "active",
            
213
      "vocabulary_id": null
237
      "vocabulary_id": null
            
214
    },
238
    },
            
215
    {
239
    {
            
216
      "display_name": "seagrass",
240
      "display_name": "seagrass",
            
217
      "id": "5824ced6-3e9f-41c8-abac-b98bcff0e203",
241
      "id": "5824ced6-3e9f-41c8-abac-b98bcff0e203",
            
218
      "name": "seagrass",
242
      "name": "seagrass",
            
219
      "state": "active",
243
      "state": "active",
            
220
      "vocabulary_id": null
244
      "vocabulary_id": null
            
221
    }
245
    }
            
222
  ],
246
  ],
            
223
  "title": "Macroinfaunal functional group analysis in shallow water 
247
  "title": "Macroinfaunal functional group analysis in shallow water 
            
224
habitats around the Chandeleur Islands in 2015 and 2016",
248
habitats around the Chandeleur Islands in 2015 and 2016",
            
225
  "type": "dataset",
249
  "type": "dataset",
            
226
  "url": null,
250
  "url": null,
            
227
  "version": null
251
  "version": null
            
228
}
252
}