Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Patricia Sobecky",
2
  "author": "Patricia Sobecky",
            
3
  "author_email": "psobecky@ua.edu",
3
  "author_email": "psobecky@ua.edu",
            
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
            
5
  "extras": [
5
  "extras": [
            
6
    {
6
    {
            
7
      "key": "DOI",
7
      "key": "DOI",
            
8
      "value": "doi:10.7266/N7V69H36"
8
      "value": "doi:10.7266/N7V69H36"
            
9
    },
9
    },
            
10
    {
10
    {
            
11
      "key": "ISO.pointOfContact",
11
      "key": "ISO.pointOfContact",
            
12
      "value": "Patricia Sobecky <psobecky@ua.edu>"
12
      "value": "Patricia Sobecky <psobecky@ua.edu>"
            
13
    },
13
    },
            
14
    {
14
    {
            
15
      "key": "Place Keywords",
15
      "key": "Place Keywords",
            
16
      "value": "Chandeleur Islands, Gulf of Mexico, Louisiana"
16
      "value": "Chandeleur Islands, Gulf of Mexico, Louisiana"
            
17
    },
17
    },
            
18
    {
18
    {
            
19
      "key": "Temporal Begin",
19
      "key": "Temporal Begin",
            
20
      "value": "2016-05-24"
20
      "value": "2016-05-24"
            
21
    },
21
    },
            
22
    {
22
    {
            
23
      "key": "Temporal End",
23
      "key": "Temporal End",
            
24
      "value": "2017-02-23"
24
      "value": "2017-02-23"
            
25
    },
25
    },
            
26
    {
26
    {
            
27
      "key": "Theme Keywords",
27
      "key": "Theme Keywords",
            
28
      "value": "denitrification, biodiversity, 16S rRNA amplicon 
28
      "value": "denitrification, biodiversity, 16S rRNA amplicon 
            
29
sequencing, salt marsh, Deepwater Horizon"
29
sequencing, salt marsh, Deepwater Horizon"
            
30
    },
30
    },
            
31
    {
31
    {
            
32
      "key": "spatial",
32
      "key": "spatial",
            
33
      "value": "{ \"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [ [ [ 
33
      "value": "{ \"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [ [ [ 
            
34
-88.84147, 29.92761 ], [ -88.82931, 29.92761 ], [ -88.82931, 29.86375 
34
-88.84147, 29.92761 ], [ -88.82931, 29.92761 ], [ -88.82931, 29.86375 
            
35
], [ -88.84147, 29.86375 ], [ -88.84147, 29.92761 ] ] ] }"
35
], [ -88.84147, 29.86375 ], [ -88.84147, 29.92761 ] ] ] }"
            
36
    }
36
    }
            
37
  ],
37
  ],
            
38
  "groups": [],
38
  "groups": [],
            
39
  "id": "f81a3fe9-5bad-4c02-8463-5f75bb80d2f9",
39
  "id": "f81a3fe9-5bad-4c02-8463-5f75bb80d2f9",
            
40
  "isopen": false,
40
  "isopen": false,
            
41
  "license_id": null,
41
  "license_id": null,
            
42
  "license_title": null,
42
  "license_title": null,
            
43
  "maintainer": "data@disl.org",
43
  "maintainer": "data@disl.org",
            
44
  "maintainer_email": "data@disl.org",
44
  "maintainer_email": "data@disl.org",
            
45
  "metadata_created": "2022-07-27T14:33:51.472139",
45
  "metadata_created": "2022-07-27T14:33:51.472139",
            
n
46
  "metadata_modified": "2022-07-27T14:35:56.649732",
n
46
  "metadata_modified": "2022-10-10T21:22:01.299658",
            
47
  "name": 
47
  "name": 
            
48
sland-louisiana-salt-marsh-microbial-communities-a-6-year-pon7v69h36",
48
sland-louisiana-salt-marsh-microbial-communities-a-6-year-pon7v69h36",
            
49
  "notes": "### Abstract\nAs oil was deposited differentially within 
49
  "notes": "### Abstract\nAs oil was deposited differentially within 
            
50
Chandeleur Island salt marshes, it was important to investigate the 
50
Chandeleur Island salt marshes, it was important to investigate the 
            
51
microbiology of oil-impacted areas as marsh vegetation is directly 
51
microbiology of oil-impacted areas as marsh vegetation is directly 
            
52
linked to microbe-driven ecosystem services such as denitrification, a 
52
linked to microbe-driven ecosystem services such as denitrification, a 
            
53
nitrogen (N) cycle pathway. Genomic DNA was extracted from the top 
53
nitrogen (N) cycle pathway. Genomic DNA was extracted from the top 
            
54
0-7cm of sediment cores at six time points (May 2016, June 2016, 
54
0-7cm of sediment cores at six time points (May 2016, June 2016, 
            
55
September 2016, October 2016, November 2016, February 2017) from three 
55
September 2016, October 2016, November 2016, February 2017) from three 
            
56
salt marsh locales within the Chandeleur Islands. Microbial community 
56
salt marsh locales within the Chandeleur Islands. Microbial community 
            
57
abundance and biodiversity were characterized with 16S rRNA using 
57
abundance and biodiversity were characterized with 16S rRNA using 
            
58
Illumina MiSeq 2x 300 bp technology for 17 samples.\n\n### 
58
Illumina MiSeq 2x 300 bp technology for 17 samples.\n\n### 
            
59
Purpose\nThis 16S rRNA amplicon dataset is a 6 year post-Deepwater 
59
Purpose\nThis 16S rRNA amplicon dataset is a 6 year post-Deepwater 
            
60
Horizon impact study which aimed to characterize the microbial 
60
Horizon impact study which aimed to characterize the microbial 
            
61
biodiversity of three salt marsh locales within the Chandeleur 
61
biodiversity of three salt marsh locales within the Chandeleur 
            
62
Islands.\n\n**DOI: 
62
Islands.\n\n**DOI: 
            
63
[doi:10.7266/N7V69H36](https://www.doi.org/10.7266/N7V69H36)**\n\n### 
63
[doi:10.7266/N7V69H36](https://www.doi.org/10.7266/N7V69H36)**\n\n### 
            
64
Suggested Citation\nSobecky, Patricia; Flournoy, Nikaela. 2018. 
64
Suggested Citation\nSobecky, Patricia; Flournoy, Nikaela. 2018. 
            
65
Characterization of Chandeleur Island, Louisiana, Salt Marsh Microbial 
65
Characterization of Chandeleur Island, Louisiana, Salt Marsh Microbial 
            
66
Communities: A 6 year post-Deepwater Horizon Impact Study, May 
66
Communities: A 6 year post-Deepwater Horizon Impact Study, May 
            
67
2016-February 2017. Distributed by: Gulf of Mexico Research Initiative 
67
2016-February 2017. Distributed by: Gulf of Mexico Research Initiative 
            
68
Information and Data Cooperative (GRIIDC), Harte Research Institute, 
68
Information and Data Cooperative (GRIIDC), Harte Research Institute, 
            
69
Texas A&M University\u2013Corpus Christi. doi:10.7266/N7V69H36\n\n### 
69
Texas A&M University\u2013Corpus Christi. doi:10.7266/N7V69H36\n\n### 
            
70
Related Publication Citation\n[Tatariw, C., Flournoy, N., Kleinhuizen, 
70
Related Publication Citation\n[Tatariw, C., Flournoy, N., Kleinhuizen, 
            
71
A. A., Tollette, D., Overton, E. B., Sobecky, P. A., & Mortazavi, B. 
71
A. A., Tollette, D., Overton, E. B., Sobecky, P. A., & Mortazavi, B. 
            
72
(2018). Salt marsh denitrification is impacted by oiling intensity six 
72
(2018). Salt marsh denitrification is impacted by oiling intensity six 
            
73
years after the Deepwater Horizon oil spill. Environmental Pollution, 
73
years after the Deepwater Horizon oil spill. Environmental Pollution, 
            
74
243, 1606\u20131614. 
74
243, 1606\u20131614. 
            
75
09.034\n](https://dx.doi.org/10.1016/j.envpol.2018.09.034)\n\n**Funded 
75
09.034\n](https://dx.doi.org/10.1016/j.envpol.2018.09.034)\n\n**Funded 
            
76
by:** Gulf of Mexico Research Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** 
76
by:** Gulf of Mexico Research Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** 
            
77
RFP-IV\n\n**Research group:** Alabama Center for Ecological Resilience 
77
RFP-IV\n\n**Research group:** Alabama Center for Ecological Resilience 
            
78
(ACER)\n\n",
78
(ACER)\n\n",
            
79
  "num_resources": 2,
79
  "num_resources": 2,
            
n
80
  "num_tags": 8,
n
80
  "num_tags": 0,
            
81
  "organization": {
81
  "organization": {
            
82
    "approval_status": "approved",
82
    "approval_status": "approved",
            
83
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
83
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
            
n
84
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
n
84
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab's (DISL) mission is to 
            
85
become a center for transformative U.S. oceanic and coastal research 
            
86
and education.. Founded in 1971 by the State of Alabama Legislature to 
            
87
maximize the marine sciences capabilities of several Alabama 
            
88
institutions and minimize duplication. \r\n\r\nLocated on the eastern 
            
89
tip of Dauphin Island, a barrier island in the northern Gulf of 
            
90
Mexico, DISL is surrounded by Mobile Bay, the Mississippi Sound, and 
            
91
the waters of the Gulf, making it a perfect location to conduct a wide 
            
92
range of marine science activity. \r\n\r\n[The University Programs 
            
93
(UP)](https://www.disl.edu/univ-prog/) serves the students of the 
            
94
Marine Environmental Sciences Consortium\u2019s (MESC) 22 public and 
            
95
private four-year colleges and universities through graduate and 
            
96
undergraduate programs. Throughout the year, graduate students conduct 
            
97
research, and attend classes while completing their degree under the 
            
98
mentorship of faculty and staff at the Dauphin Island Sea Lab.  
            
99
\r\n\r\n[The Discovery Hall Programs (DHP)](https://www.disl.edu/dhp/) 
            
100
oversees educational programs for K-12 field programs, 
            
101
teacher-training, and community outreach opportunities.  \r\n[The 
            
102
Estuarium](https://www.disl.edu/aquarium/), our public aquarium 
            
103
located on the Dauphin Island Sea Lab campus, is a part of DHP's 
            
104
educational outreach mission. The Estuarium focuses solely on the 
            
105
Mobile-Tensaw Estuary System. The BayMobile allows DHP educators to 
            
106
bring marine science to students across Alabama in the classroom and 
            
107
at community events. \r\n\r\nResearch programs at the Dauphin Island 
            
108
Sea Lab range from biogeochemistry and oceanography to ecosystem 
            
109
ecology. While much of our research focuses on the near-shore and 
            
110
estuarine processes of the northern Gulf of Mexico, field sites of our 
            
111
internationally-renowned faculty also include the Arctic, Mexico, 
            
112
Australia, and other countries.\r\n\r\nThe Dauphin Island Sea Lab also 
            
113
offers state and local government, industry, and agency 
            
114
decision-makers a range of coastal zone management services, including 
            
115
access to the nationally acclaimed data management center. Armed with 
            
116
data through the DISL data management center, entities can make 
            
117
well-informed decisions and sound policies while considering 
            
118
environmental impact. Another key contributor to successful coastal 
            
119
zone management is the Mobile Bay National Estuary Program, which 
            
120
falls within the services of DISL.\r\n\r\n",
            
85
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
121
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
n
86
    "image_url": "",
n
122
    "image_url": 
            
123
"2022-07-29-144848.512466DISL-centered-logo-w-Tag-CMYK.svg",
            
87
    "is_organization": true,
124
    "is_organization": true,
            
88
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
125
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
            
89
    "state": "active",
126
    "state": "active",
            
90
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
127
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
            
91
    "type": "organization"
128
    "type": "organization"
            
92
  },
129
  },
            
93
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
130
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
94
  "private": false,
131
  "private": false,
            
95
  "relationships_as_object": [],
132
  "relationships_as_object": [],
            
96
  "relationships_as_subject": [],
133
  "relationships_as_subject": [],
            
97
  "resources": [
134
  "resources": [
            
98
    {
135
    {
            
99
      "cache_last_updated": null,
136
      "cache_last_updated": null,
            
100
      "cache_url": null,
137
      "cache_url": null,
            
101
      "created": "2022-07-27T14:33:51.908676",
138
      "created": "2022-07-27T14:33:51.908676",
            
102
      "datastore_active": false,
139
      "datastore_active": false,
            
103
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
140
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
104
      "description": null,
141
      "description": null,
            
105
      "format": "XML",
142
      "format": "XML",
            
106
      "hash": "",
143
      "hash": "",
            
107
      "id": "f4c58e59-9741-4416-957e-55389ceb1b7b",
144
      "id": "f4c58e59-9741-4416-957e-55389ceb1b7b",
            
108
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:51.874979",
145
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:51.874979",
            
109
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:52.328968",
146
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:52.328968",
            
110
      "mimetype": "application/xml",
147
      "mimetype": "application/xml",
            
111
      "mimetype_inner": null,
148
      "mimetype_inner": null,
            
112
      "name": "R4.x262.000-0036-metadata.xml",
149
      "name": "R4.x262.000-0036-metadata.xml",
            
113
      "package_id": "f81a3fe9-5bad-4c02-8463-5f75bb80d2f9",
150
      "package_id": "f81a3fe9-5bad-4c02-8463-5f75bb80d2f9",
            
114
      "position": 0,
151
      "position": 0,
            
115
      "resource_type": null,
152
      "resource_type": null,
            
116
      "size": 28769,
153
      "size": 28769,
            
117
      "state": "active",
154
      "state": "active",
            
118
      "url": 
155
      "url": 
            
119
9-9741-4416-957e-55389ceb1b7b/download/r4.x262.000-0036-metadata.xml",
156
9-9741-4416-957e-55389ceb1b7b/download/r4.x262.000-0036-metadata.xml",
            
120
      "url_type": "upload"
157
      "url_type": "upload"
            
121
    },
158
    },
            
122
    {
159
    {
            
123
      "cache_last_updated": null,
160
      "cache_last_updated": null,
            
124
      "cache_url": null,
161
      "cache_url": null,
            
125
      "ckan_url": "https://data.disl.edu",
162
      "ckan_url": "https://data.disl.edu",
            
126
      "created": "2022-07-27T14:33:52.365205",
163
      "created": "2022-07-27T14:33:52.365205",
            
127
      "datastore_active": true,
164
      "datastore_active": true,
            
128
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": true,
165
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": true,
            
129
      "description": null,
166
      "description": null,
            
130
      "format": "CSV",
167
      "format": "CSV",
            
131
      "hash": "29e7484c26a680dba52e5efa64963444",
168
      "hash": "29e7484c26a680dba52e5efa64963444",
            
132
      "id": "cd6080df-b120-4793-8528-e11e62d9b55e",
169
      "id": "cd6080df-b120-4793-8528-e11e62d9b55e",
            
n
133
      "ignore_hash": false,
n
170
      "ignore_hash": true,
            
134
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:52.308754",
171
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:52.308754",
            
135
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:35:56.664299",
172
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:35:56.664299",
            
136
      "mimetype": "text/csv",
173
      "mimetype": "text/csv",
            
137
      "mimetype_inner": null,
174
      "mimetype_inner": null,
            
138
      "name": "salt_marsh_microbial_communities.csv",
175
      "name": "salt_marsh_microbial_communities.csv",
            
139
      "original_url": 
176
      "original_url": 
            
140
4793-8528-e11e62d9b55e/download/salt_marsh_microbial_communities.csv",
177
4793-8528-e11e62d9b55e/download/salt_marsh_microbial_communities.csv",
            
141
      "package_id": "f81a3fe9-5bad-4c02-8463-5f75bb80d2f9",
178
      "package_id": "f81a3fe9-5bad-4c02-8463-5f75bb80d2f9",
            
142
      "position": 1,
179
      "position": 1,
            
143
      "resource_id": "cd6080df-b120-4793-8528-e11e62d9b55e",
180
      "resource_id": "cd6080df-b120-4793-8528-e11e62d9b55e",
            
144
      "resource_type": null,
181
      "resource_type": null,
            
145
      "set_url_type": false,
182
      "set_url_type": false,
            
146
      "size": 5300,
183
      "size": 5300,
            
147
      "state": "active",
184
      "state": "active",
            
n
148
      "task_created": "2022-07-27 14:33:52.595767",
n
185
      "task_created": "2022-10-10 21:15:21.017534",
            
149
      "url": 
186
      "url": 
            
150
4793-8528-e11e62d9b55e/download/salt_marsh_microbial_communities.csv",
187
4793-8528-e11e62d9b55e/download/salt_marsh_microbial_communities.csv",
            
151
      "url_type": "upload"
188
      "url_type": "upload"
            
152
    }
189
    }
            
153
  ],
190
  ],
            
154
  "state": "active",
191
  "state": "active",
            
t
155
  "tags": [
t
192
  "tags": [],
            
156
    {

            
157
      "display_name": "16S rRNA amplicon sequencing",

            
158
      "id": "86e7fbd9-c370-4f1b-9ff7-6ec7950ec6cb",

            
159
      "name": "16S rRNA amplicon sequencing",

            
160
      "state": "active",

            
161
      "vocabulary_id": null

            
162
    },

            
163
    {

            
164
      "display_name": "Chandeleur Islands",

            
165
      "id": "1187d400-d9de-4166-aca2-2e591ecf8c65",

            
166
      "name": "Chandeleur Islands",

            
167
      "state": "active",

            
168
      "vocabulary_id": null

            
169
    },

            
170
    {

            
171
      "display_name": "Deepwater Horizon",

            
172
      "id": "0e13401a-3910-4b7f-9e17-df754fe3f24a",

            
173
      "name": "Deepwater Horizon",

            
174
      "state": "active",

            
175
      "vocabulary_id": null

            
176
    },

            
177
    {

            
178
      "display_name": "Gulf of Mexico",

            
179
      "id": "26b2a6bc-e01b-4c22-9d3f-5bbcd148cc4f",

            
180
      "name": "Gulf of Mexico",

            
181
      "state": "active",

            
182
      "vocabulary_id": null

            
183
    },

            
184
    {

            
185
      "display_name": "Louisiana",

            
186
      "id": "d7699c97-9202-4624-bb36-265d2a628a57",

            
187
      "name": "Louisiana",

            
188
      "state": "active",

            
189
      "vocabulary_id": null

            
190
    },

            
191
    {

            
192
      "display_name": "biodiversity",

            
193
      "id": "16737851-e341-4f85-a496-dd82131afef6",

            
194
      "name": "biodiversity",

            
195
      "state": "active",

            
196
      "vocabulary_id": null

            
197
    },

            
198
    {

            
199
      "display_name": "denitrification",

            
200
      "id": "ef3cdb87-1cb1-463e-b2d0-5d94ea0794b0",

            
201
      "name": "denitrification",

            
202
      "state": "active",

            
203
      "vocabulary_id": null

            
204
    },

            
205
    {

            
206
      "display_name": "salt marsh",

            
207
      "id": "5c257f3f-a48e-47b6-a1cc-4113dc5cea33",

            
208
      "name": "salt marsh",

            
209
      "state": "active",

            
210
      "vocabulary_id": null

            
211
    }

            
212
  ],

            
213
  "title": "Characterization of Chandeleur Island, Louisiana, Salt 
193
  "title": "Characterization of Chandeleur Island, Louisiana, Salt 
            
214
Marsh Microbial Communities: A 6 year post-Deepwater Horizon Impact 
194
Marsh Microbial Communities: A 6 year post-Deepwater Horizon Impact 
            
215
Study, May 2016-February 2017",
195
Study, May 2016-February 2017",
            
216
  "type": "dataset",
196
  "type": "dataset",
            
217
  "url": null,
197
  "url": null,
            
218
  "version": null
198
  "version": null
            
219
}
199
}