Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Patricia Sobecky",
2
  "author": "Patricia Sobecky",
            
3
  "author_email": "psobecky@ua.edu",
3
  "author_email": "psobecky@ua.edu",
            
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
            
5
  "extras": [
5
  "extras": [
            
6
    {
6
    {
            
7
      "key": "DOI",
7
      "key": "DOI",
            
8
      "value": "doi:10.7266/N7V69H36"
8
      "value": "doi:10.7266/N7V69H36"
            
9
    },
9
    },
            
10
    {
10
    {
            
11
      "key": "ISO.pointOfContact",
11
      "key": "ISO.pointOfContact",
            
12
      "value": "Patricia Sobecky <psobecky@ua.edu>"
12
      "value": "Patricia Sobecky <psobecky@ua.edu>"
            
13
    },
13
    },
            
14
    {
14
    {
            
15
      "key": "Place Keywords",
15
      "key": "Place Keywords",
            
16
      "value": "Chandeleur Islands, Gulf of Mexico, Louisiana"
16
      "value": "Chandeleur Islands, Gulf of Mexico, Louisiana"
            
17
    },
17
    },
            
18
    {
18
    {
            
19
      "key": "Temporal Begin",
19
      "key": "Temporal Begin",
            
20
      "value": "2016-05-24"
20
      "value": "2016-05-24"
            
21
    },
21
    },
            
22
    {
22
    {
            
23
      "key": "Temporal End",
23
      "key": "Temporal End",
            
24
      "value": "2017-02-23"
24
      "value": "2017-02-23"
            
25
    },
25
    },
            
26
    {
26
    {
            
27
      "key": "Theme Keywords",
27
      "key": "Theme Keywords",
            
28
      "value": "denitrification, biodiversity, 16S rRNA amplicon 
28
      "value": "denitrification, biodiversity, 16S rRNA amplicon 
            
29
sequencing, salt marsh, Deepwater Horizon"
29
sequencing, salt marsh, Deepwater Horizon"
            
30
    },
30
    },
            
31
    {
31
    {
            
32
      "key": "spatial",
32
      "key": "spatial",
            
33
      "value": "{ \"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [ [ [ 
33
      "value": "{ \"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [ [ [ 
            
34
-88.84147, 29.92761 ], [ -88.82931, 29.92761 ], [ -88.82931, 29.86375 
34
-88.84147, 29.92761 ], [ -88.82931, 29.92761 ], [ -88.82931, 29.86375 
            
35
], [ -88.84147, 29.86375 ], [ -88.84147, 29.92761 ] ] ] }"
35
], [ -88.84147, 29.86375 ], [ -88.84147, 29.92761 ] ] ] }"
            
36
    }
36
    }
            
37
  ],
37
  ],
            
38
  "groups": [],
38
  "groups": [],
            
39
  "id": "f81a3fe9-5bad-4c02-8463-5f75bb80d2f9",
39
  "id": "f81a3fe9-5bad-4c02-8463-5f75bb80d2f9",
            
40
  "isopen": false,
40
  "isopen": false,
            
41
  "license_id": null,
41
  "license_id": null,
            
42
  "license_title": null,
42
  "license_title": null,
            
43
  "maintainer": "data@disl.org",
43
  "maintainer": "data@disl.org",
            
44
  "maintainer_email": "data@disl.org",
44
  "maintainer_email": "data@disl.org",
            
45
  "metadata_created": "2022-07-27T14:33:51.472139",
45
  "metadata_created": "2022-07-27T14:33:51.472139",
            
n
46
  "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:51.472149",
n
46
  "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:51.883055",
            
47
  "name": 
47
  "name": 
            
48
sland-louisiana-salt-marsh-microbial-communities-a-6-year-pon7v69h36",
48
sland-louisiana-salt-marsh-microbial-communities-a-6-year-pon7v69h36",
            
49
  "notes": "### Abstract\nAs oil was deposited differentially within 
49
  "notes": "### Abstract\nAs oil was deposited differentially within 
            
50
Chandeleur Island salt marshes, it was important to investigate the 
50
Chandeleur Island salt marshes, it was important to investigate the 
            
51
microbiology of oil-impacted areas as marsh vegetation is directly 
51
microbiology of oil-impacted areas as marsh vegetation is directly 
            
52
linked to microbe-driven ecosystem services such as denitrification, a 
52
linked to microbe-driven ecosystem services such as denitrification, a 
            
53
nitrogen (N) cycle pathway. Genomic DNA was extracted from the top 
53
nitrogen (N) cycle pathway. Genomic DNA was extracted from the top 
            
54
0-7cm of sediment cores at six time points (May 2016, June 2016, 
54
0-7cm of sediment cores at six time points (May 2016, June 2016, 
            
55
September 2016, October 2016, November 2016, February 2017) from three 
55
September 2016, October 2016, November 2016, February 2017) from three 
            
56
salt marsh locales within the Chandeleur Islands. Microbial community 
56
salt marsh locales within the Chandeleur Islands. Microbial community 
            
57
abundance and biodiversity were characterized with 16S rRNA using 
57
abundance and biodiversity were characterized with 16S rRNA using 
            
58
Illumina MiSeq 2x 300 bp technology for 17 samples.\n\n### 
58
Illumina MiSeq 2x 300 bp technology for 17 samples.\n\n### 
            
59
Purpose\nThis 16S rRNA amplicon dataset is a 6 year post-Deepwater 
59
Purpose\nThis 16S rRNA amplicon dataset is a 6 year post-Deepwater 
            
60
Horizon impact study which aimed to characterize the microbial 
60
Horizon impact study which aimed to characterize the microbial 
            
61
biodiversity of three salt marsh locales within the Chandeleur 
61
biodiversity of three salt marsh locales within the Chandeleur 
            
62
Islands.\n\n**DOI: 
62
Islands.\n\n**DOI: 
            
63
[doi:10.7266/N7V69H36](https://www.doi.org/10.7266/N7V69H36)**\n\n### 
63
[doi:10.7266/N7V69H36](https://www.doi.org/10.7266/N7V69H36)**\n\n### 
            
64
Suggested Citation\nSobecky, Patricia; Flournoy, Nikaela. 2018. 
64
Suggested Citation\nSobecky, Patricia; Flournoy, Nikaela. 2018. 
            
65
Characterization of Chandeleur Island, Louisiana, Salt Marsh Microbial 
65
Characterization of Chandeleur Island, Louisiana, Salt Marsh Microbial 
            
66
Communities: A 6 year post-Deepwater Horizon Impact Study, May 
66
Communities: A 6 year post-Deepwater Horizon Impact Study, May 
            
67
2016-February 2017. Distributed by: Gulf of Mexico Research Initiative 
67
2016-February 2017. Distributed by: Gulf of Mexico Research Initiative 
            
68
Information and Data Cooperative (GRIIDC), Harte Research Institute, 
68
Information and Data Cooperative (GRIIDC), Harte Research Institute, 
            
69
Texas A&M University\u2013Corpus Christi. doi:10.7266/N7V69H36\n\n### 
69
Texas A&M University\u2013Corpus Christi. doi:10.7266/N7V69H36\n\n### 
            
70
Related Publication Citation\n[Tatariw, C., Flournoy, N., Kleinhuizen, 
70
Related Publication Citation\n[Tatariw, C., Flournoy, N., Kleinhuizen, 
            
71
A. A., Tollette, D., Overton, E. B., Sobecky, P. A., & Mortazavi, B. 
71
A. A., Tollette, D., Overton, E. B., Sobecky, P. A., & Mortazavi, B. 
            
72
(2018). Salt marsh denitrification is impacted by oiling intensity six 
72
(2018). Salt marsh denitrification is impacted by oiling intensity six 
            
73
years after the Deepwater Horizon oil spill. Environmental Pollution, 
73
years after the Deepwater Horizon oil spill. Environmental Pollution, 
            
74
243, 1606\u20131614. 
74
243, 1606\u20131614. 
            
75
09.034\n](https://dx.doi.org/10.1016/j.envpol.2018.09.034)\n\n**Funded 
75
09.034\n](https://dx.doi.org/10.1016/j.envpol.2018.09.034)\n\n**Funded 
            
76
by:** Gulf of Mexico Research Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** 
76
by:** Gulf of Mexico Research Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** 
            
77
RFP-IV\n\n**Research group:** Alabama Center for Ecological Resilience 
77
RFP-IV\n\n**Research group:** Alabama Center for Ecological Resilience 
            
78
(ACER)\n\n",
78
(ACER)\n\n",
            
n
79
  "num_resources": 0,
n
79
  "num_resources": 1,
            
80
  "num_tags": 8,
80
  "num_tags": 8,
            
81
  "organization": {
81
  "organization": {
            
82
    "approval_status": "approved",
82
    "approval_status": "approved",
            
83
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
83
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
            
84
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
84
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
            
85
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
85
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
86
    "image_url": "",
86
    "image_url": "",
            
87
    "is_organization": true,
87
    "is_organization": true,
            
88
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
88
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
            
89
    "state": "active",
89
    "state": "active",
            
90
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
90
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
            
91
    "type": "organization"
91
    "type": "organization"
            
92
  },
92
  },
            
93
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
93
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
94
  "private": false,
94
  "private": false,
            
95
  "relationships_as_object": [],
95
  "relationships_as_object": [],
            
96
  "relationships_as_subject": [],
96
  "relationships_as_subject": [],
            
t
97
  "resources": [],
t
97
  "resources": [
            
98
    {
            
99
      "cache_last_updated": null,
            
100
      "cache_url": null,
            
101
      "created": "2022-07-27T14:33:51.908676",
            
102
      "datastore_active": false,
            
103
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
104
      "description": null,
            
105
      "format": "XML",
            
106
      "hash": "",
            
107
      "id": "f4c58e59-9741-4416-957e-55389ceb1b7b",
            
108
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:51.874979",
            
109
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:51.887306",
            
110
      "mimetype": "application/xml",
            
111
      "mimetype_inner": null,
            
112
      "name": "R4.x262.000-0036-metadata.xml",
            
113
      "package_id": "f81a3fe9-5bad-4c02-8463-5f75bb80d2f9",
            
114
      "position": 0,
            
115
      "resource_type": null,
            
116
      "size": 28769,
            
117
      "state": "active",
            
118
      "url": 
            
119
9-9741-4416-957e-55389ceb1b7b/download/r4.x262.000-0036-metadata.xml",
            
120
      "url_type": "upload"
            
121
    }
            
122
  ],
            
98
  "state": "active",
123
  "state": "active",
            
99
  "tags": [
124
  "tags": [
            
100
    {
125
    {
            
101
      "display_name": "16S rRNA amplicon sequencing",
126
      "display_name": "16S rRNA amplicon sequencing",
            
102
      "id": "86e7fbd9-c370-4f1b-9ff7-6ec7950ec6cb",
127
      "id": "86e7fbd9-c370-4f1b-9ff7-6ec7950ec6cb",
            
103
      "name": "16S rRNA amplicon sequencing",
128
      "name": "16S rRNA amplicon sequencing",
            
104
      "state": "active",
129
      "state": "active",
            
105
      "vocabulary_id": null
130
      "vocabulary_id": null
            
106
    },
131
    },
            
107
    {
132
    {
            
108
      "display_name": "Chandeleur Islands",
133
      "display_name": "Chandeleur Islands",
            
109
      "id": "1187d400-d9de-4166-aca2-2e591ecf8c65",
134
      "id": "1187d400-d9de-4166-aca2-2e591ecf8c65",
            
110
      "name": "Chandeleur Islands",
135
      "name": "Chandeleur Islands",
            
111
      "state": "active",
136
      "state": "active",
            
112
      "vocabulary_id": null
137
      "vocabulary_id": null
            
113
    },
138
    },
            
114
    {
139
    {
            
115
      "display_name": "Deepwater Horizon",
140
      "display_name": "Deepwater Horizon",
            
116
      "id": "0e13401a-3910-4b7f-9e17-df754fe3f24a",
141
      "id": "0e13401a-3910-4b7f-9e17-df754fe3f24a",
            
117
      "name": "Deepwater Horizon",
142
      "name": "Deepwater Horizon",
            
118
      "state": "active",
143
      "state": "active",
            
119
      "vocabulary_id": null
144
      "vocabulary_id": null
            
120
    },
145
    },
            
121
    {
146
    {
            
122
      "display_name": "Gulf of Mexico",
147
      "display_name": "Gulf of Mexico",
            
123
      "id": "26b2a6bc-e01b-4c22-9d3f-5bbcd148cc4f",
148
      "id": "26b2a6bc-e01b-4c22-9d3f-5bbcd148cc4f",
            
124
      "name": "Gulf of Mexico",
149
      "name": "Gulf of Mexico",
            
125
      "state": "active",
150
      "state": "active",
            
126
      "vocabulary_id": null
151
      "vocabulary_id": null
            
127
    },
152
    },
            
128
    {
153
    {
            
129
      "display_name": "Louisiana",
154
      "display_name": "Louisiana",
            
130
      "id": "d7699c97-9202-4624-bb36-265d2a628a57",
155
      "id": "d7699c97-9202-4624-bb36-265d2a628a57",
            
131
      "name": "Louisiana",
156
      "name": "Louisiana",
            
132
      "state": "active",
157
      "state": "active",
            
133
      "vocabulary_id": null
158
      "vocabulary_id": null
            
134
    },
159
    },
            
135
    {
160
    {
            
136
      "display_name": "biodiversity",
161
      "display_name": "biodiversity",
            
137
      "id": "16737851-e341-4f85-a496-dd82131afef6",
162
      "id": "16737851-e341-4f85-a496-dd82131afef6",
            
138
      "name": "biodiversity",
163
      "name": "biodiversity",
            
139
      "state": "active",
164
      "state": "active",
            
140
      "vocabulary_id": null
165
      "vocabulary_id": null
            
141
    },
166
    },
            
142
    {
167
    {
            
143
      "display_name": "denitrification",
168
      "display_name": "denitrification",
            
144
      "id": "ef3cdb87-1cb1-463e-b2d0-5d94ea0794b0",
169
      "id": "ef3cdb87-1cb1-463e-b2d0-5d94ea0794b0",
            
145
      "name": "denitrification",
170
      "name": "denitrification",
            
146
      "state": "active",
171
      "state": "active",
            
147
      "vocabulary_id": null
172
      "vocabulary_id": null
            
148
    },
173
    },
            
149
    {
174
    {
            
150
      "display_name": "salt marsh",
175
      "display_name": "salt marsh",
            
151
      "id": "5c257f3f-a48e-47b6-a1cc-4113dc5cea33",
176
      "id": "5c257f3f-a48e-47b6-a1cc-4113dc5cea33",
            
152
      "name": "salt marsh",
177
      "name": "salt marsh",
            
153
      "state": "active",
178
      "state": "active",
            
154
      "vocabulary_id": null
179
      "vocabulary_id": null
            
155
    }
180
    }
            
156
  ],
181
  ],
            
157
  "title": "Characterization of Chandeleur Island, Louisiana, Salt 
182
  "title": "Characterization of Chandeleur Island, Louisiana, Salt 
            
158
Marsh Microbial Communities: A 6 year post-Deepwater Horizon Impact 
183
Marsh Microbial Communities: A 6 year post-Deepwater Horizon Impact 
            
159
Study, May 2016-February 2017",
184
Study, May 2016-February 2017",
            
160
  "type": "dataset",
185
  "type": "dataset",
            
161
  "url": null,
186
  "url": null,
            
162
  "version": null
187
  "version": null
            
163
}
188
}