Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Patricia Sobecky",
2
  "author": "Patricia Sobecky",
            
3
  "author_email": "psobecky@ua.edu",
3
  "author_email": "psobecky@ua.edu",
            
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
            
5
  "extras": [
5
  "extras": [
            
6
    {
6
    {
            
7
      "key": "DOI",
7
      "key": "DOI",
            
8
      "value": "doi:10.7266/VGZXJT9F"
8
      "value": "doi:10.7266/VGZXJT9F"
            
9
    },
9
    },
            
10
    {
10
    {
            
11
      "key": "ISO.pointOfContact",
11
      "key": "ISO.pointOfContact",
            
12
      "value": "Patricia Sobecky <psobecky@ua.edu>"
12
      "value": "Patricia Sobecky <psobecky@ua.edu>"
            
13
    },
13
    },
            
14
    {
14
    {
            
15
      "key": "Theme Keywords",
15
      "key": "Theme Keywords",
            
16
      "value": "denitrification, functional marker gene abundance, 
16
      "value": "denitrification, functional marker gene abundance, 
            
17
mesocosm, oil contamination"
17
mesocosm, oil contamination"
            
18
    }
18
    }
            
19
  ],
19
  ],
            
20
  "groups": [],
20
  "groups": [],
            
21
  "id": "6d53b10d-1e06-4c54-8144-aacdbfee9204",
21
  "id": "6d53b10d-1e06-4c54-8144-aacdbfee9204",
            
22
  "isopen": false,
22
  "isopen": false,
            
23
  "license_id": null,
23
  "license_id": null,
            
24
  "license_title": null,
24
  "license_title": null,
            
25
  "maintainer": "data@disl.org",
25
  "maintainer": "data@disl.org",
            
26
  "maintainer_email": "data@disl.org",
26
  "maintainer_email": "data@disl.org",
            
27
  "metadata_created": "2022-07-27T14:34:33.856771",
27
  "metadata_created": "2022-07-27T14:34:33.856771",
            
n
28
  "metadata_modified": "2022-07-27T14:34:33.856781",
n
28
  "metadata_modified": "2022-07-27T14:34:34.307145",
            
29
  "name": 
29
  "name": 
            
30
al-marker-gene-abundance-from-sediments-associated-with-genovgzxjt9f",
30
al-marker-gene-abundance-from-sediments-associated-with-genovgzxjt9f",
            
31
  "notes": "### Abstract\nThis data was generated from a a mesocosm 
31
  "notes": "### Abstract\nThis data was generated from a a mesocosm 
            
32
project to examine the effect of oil exposure on denitrifier 
32
project to examine the effect of oil exposure on denitrifier 
            
33
functional abundance within sediments associated with genotypically 
33
functional abundance within sediments associated with genotypically 
            
34
diverse plant species. Sediments samples were collected from control 
34
diverse plant species. Sediments samples were collected from control 
            
35
and oil-amended mesocosms set up at Dauphin Island Sea Lab that 
35
and oil-amended mesocosms set up at Dauphin Island Sea Lab that 
            
36
consisted of Avicennia germinans (black mangrove) co-occurring with 
36
consisted of Avicennia germinans (black mangrove) co-occurring with 
            
37
mono- or polycultures of Spartina alterniflora (smooth cord grass). 
37
mono- or polycultures of Spartina alterniflora (smooth cord grass). 
            
38
Data were collected in triplicates from control and amended mesocosms 
38
Data were collected in triplicates from control and amended mesocosms 
            
39
at three time points, before treatment in September 2015, 6 months 
39
at three time points, before treatment in September 2015, 6 months 
            
40
after treatment in April 2016, and 11 months after treatment in 
40
after treatment in April 2016, and 11 months after treatment in 
            
41
September 2016. Additional data from this mesocosm study can be found 
41
September 2016. Additional data from this mesocosm study can be found 
            
42
in GRIIDC datasets R4.x262.000:0021, R4.x262.000:0026, and 
42
in GRIIDC datasets R4.x262.000:0021, R4.x262.000:0026, and 
            
43
R4.x262.000:0034.\n\n### Purpose\nThe purpose of this study was to 
43
R4.x262.000:0034.\n\n### Purpose\nThe purpose of this study was to 
            
44
enumerate genes involved in denitrification from mesocosm sediment 
44
enumerate genes involved in denitrification from mesocosm sediment 
            
45
samples associated with mono- and polycultures of Spartina 
45
samples associated with mono- and polycultures of Spartina 
            
46
alterniflora co-occuring with Avicennia germinans that either were or 
46
alterniflora co-occuring with Avicennia germinans that either were or 
            
47
weren\u2019t exposed to oiling.\n\n**DOI: 
47
weren\u2019t exposed to oiling.\n\n**DOI: 
            
48
[doi:10.7266/VGZXJT9F](https://www.doi.org/10.7266/VGZXJT9F)**\n\n### 
48
[doi:10.7266/VGZXJT9F](https://www.doi.org/10.7266/VGZXJT9F)**\n\n### 
            
49
Suggested Citation\nPatrice Crawford, Nikaela Flournoy. 2019. 
49
Suggested Citation\nPatrice Crawford, Nikaela Flournoy. 2019. 
            
50
Quantifying denitrifier functional marker gene abundance from 
50
Quantifying denitrifier functional marker gene abundance from 
            
51
sediments associated with genotypically diverse plant types: A 
51
sediments associated with genotypically diverse plant types: A 
            
52
mesocosms study in April and September 2016. Distributed by: Gulf of 
52
mesocosms study in April and September 2016. Distributed by: Gulf of 
            
53
Mexico Research Initiative Information and Data Cooperative (GRIIDC), 
53
Mexico Research Initiative Information and Data Cooperative (GRIIDC), 
            
54
Harte Research Institute, Texas A&M University\u2013Corpus Christi. 
54
Harte Research Institute, Texas A&M University\u2013Corpus Christi. 
            
55
doi:10.7266/VGZXJT9F\n\n**Funded by:** Gulf of Mexico Research 
55
doi:10.7266/VGZXJT9F\n\n**Funded by:** Gulf of Mexico Research 
            
56
Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** RFP-IV\n\n**Research group:** 
56
Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** RFP-IV\n\n**Research group:** 
            
57
Alabama Center for Ecological Resilience (ACER)\n\n",
57
Alabama Center for Ecological Resilience (ACER)\n\n",
            
n
58
  "num_resources": 0,
n
58
  "num_resources": 1,
            
59
  "num_tags": 4,
59
  "num_tags": 4,
            
60
  "organization": {
60
  "organization": {
            
61
    "approval_status": "approved",
61
    "approval_status": "approved",
            
62
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
62
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
            
63
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
63
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
            
64
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
64
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
65
    "image_url": "",
65
    "image_url": "",
            
66
    "is_organization": true,
66
    "is_organization": true,
            
67
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
67
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
            
68
    "state": "active",
68
    "state": "active",
            
69
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
69
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
            
70
    "type": "organization"
70
    "type": "organization"
            
71
  },
71
  },
            
72
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
72
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
73
  "private": false,
73
  "private": false,
            
74
  "relationships_as_object": [],
74
  "relationships_as_object": [],
            
75
  "relationships_as_subject": [],
75
  "relationships_as_subject": [],
            
t
76
  "resources": [],
t
76
  "resources": [
            
77
    {
            
78
      "cache_last_updated": null,
            
79
      "cache_url": null,
            
80
      "created": "2022-07-27T14:34:34.332398",
            
81
      "datastore_active": false,
            
82
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
83
      "description": null,
            
84
      "format": "XML",
            
85
      "hash": "",
            
86
      "id": "8b118d78-6db3-4dc4-9d72-138a1438e30b",
            
87
      "last_modified": "2022-07-27T14:34:34.295477",
            
88
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:34:34.313326",
            
89
      "mimetype": "application/xml",
            
90
      "mimetype_inner": null,
            
91
      "name": "R4.x262.000-0051-metadata.xml",
            
92
      "package_id": "6d53b10d-1e06-4c54-8144-aacdbfee9204",
            
93
      "position": 0,
            
94
      "resource_type": null,
            
95
      "size": 24589,
            
96
      "state": "active",
            
97
      "url": 
            
98
8-6db3-4dc4-9d72-138a1438e30b/download/r4.x262.000-0051-metadata.xml",
            
99
      "url_type": "upload"
            
100
    }
            
101
  ],
            
77
  "state": "active",
102
  "state": "active",
            
78
  "tags": [
103
  "tags": [
            
79
    {
104
    {
            
80
      "display_name": "denitrification",
105
      "display_name": "denitrification",
            
81
      "id": "ef3cdb87-1cb1-463e-b2d0-5d94ea0794b0",
106
      "id": "ef3cdb87-1cb1-463e-b2d0-5d94ea0794b0",
            
82
      "name": "denitrification",
107
      "name": "denitrification",
            
83
      "state": "active",
108
      "state": "active",
            
84
      "vocabulary_id": null
109
      "vocabulary_id": null
            
85
    },
110
    },
            
86
    {
111
    {
            
87
      "display_name": "functional marker gene abundance",
112
      "display_name": "functional marker gene abundance",
            
88
      "id": "cbabab4f-207f-45ba-9623-0bbaba1f047e",
113
      "id": "cbabab4f-207f-45ba-9623-0bbaba1f047e",
            
89
      "name": "functional marker gene abundance",
114
      "name": "functional marker gene abundance",
            
90
      "state": "active",
115
      "state": "active",
            
91
      "vocabulary_id": null
116
      "vocabulary_id": null
            
92
    },
117
    },
            
93
    {
118
    {
            
94
      "display_name": "mesocosm",
119
      "display_name": "mesocosm",
            
95
      "id": "9333be78-cf5d-4704-80af-eb8209dc6428",
120
      "id": "9333be78-cf5d-4704-80af-eb8209dc6428",
            
96
      "name": "mesocosm",
121
      "name": "mesocosm",
            
97
      "state": "active",
122
      "state": "active",
            
98
      "vocabulary_id": null
123
      "vocabulary_id": null
            
99
    },
124
    },
            
100
    {
125
    {
            
101
      "display_name": "oil contamination",
126
      "display_name": "oil contamination",
            
102
      "id": "c35d732a-94ad-4faa-9b67-4756918be772",
127
      "id": "c35d732a-94ad-4faa-9b67-4756918be772",
            
103
      "name": "oil contamination",
128
      "name": "oil contamination",
            
104
      "state": "active",
129
      "state": "active",
            
105
      "vocabulary_id": null
130
      "vocabulary_id": null
            
106
    }
131
    }
            
107
  ],
132
  ],
            
108
  "title": "Quantifying denitrifier functional marker gene abundance 
133
  "title": "Quantifying denitrifier functional marker gene abundance 
            
109
from sediments associated with genotypically diverse plant types: A 
134
from sediments associated with genotypically diverse plant types: A 
            
110
mesocosms study in April and September 2016",
135
mesocosms study in April and September 2016",
            
111
  "type": "dataset",
136
  "type": "dataset",
            
112
  "url": null,
137
  "url": null,
            
113
  "version": null
138
  "version": null
            
114
}
139
}