Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Patricia Sobecky",
2
  "author": "Patricia Sobecky",
            
3
  "author_email": "psobecky@ua.edu",
3
  "author_email": "psobecky@ua.edu",
            
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
            
5
  "extras": [
5
  "extras": [
            
6
    {
6
    {
            
7
      "key": "DOI",
7
      "key": "DOI",
            
8
      "value": "doi:10.7266/N7805123"
8
      "value": "doi:10.7266/N7805123"
            
9
    },
9
    },
            
10
    {
10
    {
            
11
      "key": "ISO.principalInvestigator",
11
      "key": "ISO.principalInvestigator",
            
12
      "value": "Patricia Sobecky <psobecky@ua.edu>"
12
      "value": "Patricia Sobecky <psobecky@ua.edu>"
            
13
    },
13
    },
            
14
    {
14
    {
            
15
      "key": "Theme Keywords",
15
      "key": "Theme Keywords",
            
16
      "value": "nitrogen cycling, sulfur cycling, microbial diversity, 
16
      "value": "nitrogen cycling, sulfur cycling, microbial diversity, 
            
17
oil contamination, biodiversity"
17
oil contamination, biodiversity"
            
18
    }
18
    }
            
19
  ],
19
  ],
            
20
  "groups": [],
20
  "groups": [],
            
21
  "id": "d12b74af-4dbe-4fda-a5e8-61ba89063957",
21
  "id": "d12b74af-4dbe-4fda-a5e8-61ba89063957",
            
22
  "isopen": false,
22
  "isopen": false,
            
23
  "license_id": null,
23
  "license_id": null,
            
24
  "license_title": null,
24
  "license_title": null,
            
25
  "maintainer": "data@disl.org",
25
  "maintainer": "data@disl.org",
            
26
  "maintainer_email": "data@disl.org",
26
  "maintainer_email": "data@disl.org",
            
27
  "metadata_created": "2022-07-27T14:33:33.559820",
27
  "metadata_created": "2022-07-27T14:33:33.559820",
            
n
28
  "metadata_modified": "2022-07-27T14:35:01.061432",
n
28
  "metadata_modified": "2022-10-10T21:22:43.766453",
            
29
  "name": 
29
  "name": 
            
30
lant-type-on-microbial-biodiversity-and-predicted-metabolic-n7805123",
30
lant-type-on-microbial-biodiversity-and-predicted-metabolic-n7805123",
            
31
  "notes": "### Abstract\nSediments were collected for a mesocosm 
31
  "notes": "### Abstract\nSediments were collected for a mesocosm 
            
32
project to examine the overall response of microbial diversity to oil 
32
project to examine the overall response of microbial diversity to oil 
            
33
exposure, plant type, and also to characterize bacterial communities 
33
exposure, plant type, and also to characterize bacterial communities 
            
34
associated nitrogen and sulfur cycling processes in marine sediments. 
34
associated nitrogen and sulfur cycling processes in marine sediments. 
            
35
Sediments samples were collected from control and amended mesocosms 
35
Sediments samples were collected from control and amended mesocosms 
            
36
set up at Dauphin Island Sea Lab that consisted of the black mangrove, 
36
set up at Dauphin Island Sea Lab that consisted of the black mangrove, 
            
37
Avicennia germinans, along with either a monoculture or polyculture of 
37
Avicennia germinans, along with either a monoculture or polyculture of 
            
38
the smooth cord grass, Spartina alterniflora. Data were collected in 
38
the smooth cord grass, Spartina alterniflora. Data were collected in 
            
39
triplicates from control and amended mesocosms at three time points, 
39
triplicates from control and amended mesocosms at three time points, 
            
40
before treatment in September 2015, 6 months after treatment in April 
40
before treatment in September 2015, 6 months after treatment in April 
            
41
2016, and 11 months after treatment in September 2016. Additional data 
41
2016, and 11 months after treatment in September 2016. Additional data 
            
42
from this mesocosm study can be found in GRIIDC datasets 
42
from this mesocosm study can be found in GRIIDC datasets 
            
43
R4.x262.000:0026 and R4.x262.000:0034.\n\n### Purpose\nThe data post 
43
R4.x262.000:0026 and R4.x262.000:0034.\n\n### Purpose\nThe data post 
            
44
analyses would offer a comprehensive view of the bacterial diversity 
44
analyses would offer a comprehensive view of the bacterial diversity 
            
45
with the mesocosm sediments and the ability to track any changes in 
45
with the mesocosm sediments and the ability to track any changes in 
            
46
bacterial community composition associated with treatment, time and 
46
bacterial community composition associated with treatment, time and 
            
47
plant type.\n\n**DOI: 
47
plant type.\n\n**DOI: 
            
48
[doi:10.7266/N7805123](https://www.doi.org/10.7266/N7805123)**\n\n### 
48
[doi:10.7266/N7805123](https://www.doi.org/10.7266/N7805123)**\n\n### 
            
49
Suggested Citation\nSuja Rajan, Patrice Crawford, Alice Kleinhuizen, 
49
Suggested Citation\nSuja Rajan, Patrice Crawford, Alice Kleinhuizen, 
            
50
Behzad Mortazavi and Patricia Sobecky. 2018. Temporal effects of 
50
Behzad Mortazavi and Patricia Sobecky. 2018. Temporal effects of 
            
51
oiling and plant type on microbial biodiversity and predicted 
51
oiling and plant type on microbial biodiversity and predicted 
            
52
metabolic function in marine sediments: A mesocosm study in 
52
metabolic function in marine sediments: A mesocosm study in 
            
53
April/September 2016. Distributed by: Gulf of Mexico Research 
53
April/September 2016. Distributed by: Gulf of Mexico Research 
            
54
Initiative Information and Data Cooperative (GRIIDC), Harte Research 
54
Initiative Information and Data Cooperative (GRIIDC), Harte Research 
            
55
Institute, Texas A&M University\u2013Corpus Christi. 
55
Institute, Texas A&M University\u2013Corpus Christi. 
            
56
doi:10.7266/N7805123\n\n**Funded by:** Gulf of Mexico Research 
56
doi:10.7266/N7805123\n\n**Funded by:** Gulf of Mexico Research 
            
57
Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** RFP-IV\n\n**Research group:** 
57
Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** RFP-IV\n\n**Research group:** 
            
58
Alabama Center for Ecological Resilience (ACER)\n\n",
58
Alabama Center for Ecological Resilience (ACER)\n\n",
            
59
  "num_resources": 3,
59
  "num_resources": 3,
            
n
60
  "num_tags": 5,
n
60
  "num_tags": 0,
            
61
  "organization": {
61
  "organization": {
            
62
    "approval_status": "approved",
62
    "approval_status": "approved",
            
63
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
63
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
            
n
64
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
n
64
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab's (DISL) mission is to 
            
65
become a center for transformative U.S. oceanic and coastal research 
            
66
and education.. Founded in 1971 by the State of Alabama Legislature to 
            
67
maximize the marine sciences capabilities of several Alabama 
            
68
institutions and minimize duplication. \r\n\r\nLocated on the eastern 
            
69
tip of Dauphin Island, a barrier island in the northern Gulf of 
            
70
Mexico, DISL is surrounded by Mobile Bay, the Mississippi Sound, and 
            
71
the waters of the Gulf, making it a perfect location to conduct a wide 
            
72
range of marine science activity. \r\n\r\n[The University Programs 
            
73
(UP)](https://www.disl.edu/univ-prog/) serves the students of the 
            
74
Marine Environmental Sciences Consortium\u2019s (MESC) 22 public and 
            
75
private four-year colleges and universities through graduate and 
            
76
undergraduate programs. Throughout the year, graduate students conduct 
            
77
research, and attend classes while completing their degree under the 
            
78
mentorship of faculty and staff at the Dauphin Island Sea Lab.  
            
79
\r\n\r\n[The Discovery Hall Programs (DHP)](https://www.disl.edu/dhp/) 
            
80
oversees educational programs for K-12 field programs, 
            
81
teacher-training, and community outreach opportunities.  \r\n[The 
            
82
Estuarium](https://www.disl.edu/aquarium/), our public aquarium 
            
83
located on the Dauphin Island Sea Lab campus, is a part of DHP's 
            
84
educational outreach mission. The Estuarium focuses solely on the 
            
85
Mobile-Tensaw Estuary System. The BayMobile allows DHP educators to 
            
86
bring marine science to students across Alabama in the classroom and 
            
87
at community events. \r\n\r\nResearch programs at the Dauphin Island 
            
88
Sea Lab range from biogeochemistry and oceanography to ecosystem 
            
89
ecology. While much of our research focuses on the near-shore and 
            
90
estuarine processes of the northern Gulf of Mexico, field sites of our 
            
91
internationally-renowned faculty also include the Arctic, Mexico, 
            
92
Australia, and other countries.\r\n\r\nThe Dauphin Island Sea Lab also 
            
93
offers state and local government, industry, and agency 
            
94
decision-makers a range of coastal zone management services, including 
            
95
access to the nationally acclaimed data management center. Armed with 
            
96
data through the DISL data management center, entities can make 
            
97
well-informed decisions and sound policies while considering 
            
98
environmental impact. Another key contributor to successful coastal 
            
99
zone management is the Mobile Bay National Estuary Program, which 
            
100
falls within the services of DISL.\r\n\r\n",
            
65
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
101
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
n
66
    "image_url": "",
n
102
    "image_url": 
            
103
"2022-07-29-144848.512466DISL-centered-logo-w-Tag-CMYK.svg",
            
67
    "is_organization": true,
104
    "is_organization": true,
            
68
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
105
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
            
69
    "state": "active",
106
    "state": "active",
            
70
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
107
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
            
71
    "type": "organization"
108
    "type": "organization"
            
72
  },
109
  },
            
73
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
110
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
74
  "private": false,
111
  "private": false,
            
75
  "relationships_as_object": [],
112
  "relationships_as_object": [],
            
76
  "relationships_as_subject": [],
113
  "relationships_as_subject": [],
            
77
  "resources": [
114
  "resources": [
            
78
    {
115
    {
            
79
      "cache_last_updated": null,
116
      "cache_last_updated": null,
            
80
      "cache_url": null,
117
      "cache_url": null,
            
81
      "created": "2022-07-27T14:33:34.239650",
118
      "created": "2022-07-27T14:33:34.239650",
            
82
      "datastore_active": false,
119
      "datastore_active": false,
            
83
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
120
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
84
      "description": null,
121
      "description": null,
            
85
      "format": "XML",
122
      "format": "XML",
            
86
      "hash": "",
123
      "hash": "",
            
87
      "id": "ff63ac81-b59d-4058-82ed-59e2ae9f7e0f",
124
      "id": "ff63ac81-b59d-4058-82ed-59e2ae9f7e0f",
            
88
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:34.193499",
125
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:34.193499",
            
89
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:34.842597",
126
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:34.842597",
            
90
      "mimetype": "application/xml",
127
      "mimetype": "application/xml",
            
91
      "mimetype_inner": null,
128
      "mimetype_inner": null,
            
92
      "name": "R4.x262.000-0025-metadata.xml",
129
      "name": "R4.x262.000-0025-metadata.xml",
            
93
      "package_id": "d12b74af-4dbe-4fda-a5e8-61ba89063957",
130
      "package_id": "d12b74af-4dbe-4fda-a5e8-61ba89063957",
            
94
      "position": 0,
131
      "position": 0,
            
95
      "resource_type": null,
132
      "resource_type": null,
            
96
      "size": 29482,
133
      "size": 29482,
            
97
      "state": "active",
134
      "state": "active",
            
98
      "url": 
135
      "url": 
            
99
1-b59d-4058-82ed-59e2ae9f7e0f/download/r4.x262.000-0025-metadata.xml",
136
1-b59d-4058-82ed-59e2ae9f7e0f/download/r4.x262.000-0025-metadata.xml",
            
100
      "url_type": "upload"
137
      "url_type": "upload"
            
101
    },
138
    },
            
102
    {
139
    {
            
103
      "cache_last_updated": null,
140
      "cache_last_updated": null,
            
104
      "cache_url": null,
141
      "cache_url": null,
            
105
      "ckan_url": "https://data.disl.edu",
142
      "ckan_url": "https://data.disl.edu",
            
106
      "created": "2022-07-27T14:33:34.856617",
143
      "created": "2022-07-27T14:33:34.856617",
            
107
      "datastore_active": true,
144
      "datastore_active": true,
            
108
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": true,
145
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": true,
            
109
      "description": null,
146
      "description": null,
            
110
      "format": "CSV",
147
      "format": "CSV",
            
111
      "hash": "4907dab5e048e61dd274c541a4679e42",
148
      "hash": "4907dab5e048e61dd274c541a4679e42",
            
112
      "id": "d8aadb4f-5217-466b-8fb4-2cce0348ba3c",
149
      "id": "d8aadb4f-5217-466b-8fb4-2cce0348ba3c",
            
n
113
      "ignore_hash": false,
n
150
      "ignore_hash": true,
            
114
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:34.831579",
151
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:34.831579",
            
115
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:35:01.074769",
152
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:35:01.074769",
            
116
      "mimetype": "text/csv",
153
      "mimetype": "text/csv",
            
117
      "mimetype_inner": null,
154
      "mimetype_inner": null,
            
118
      "name": "ACER_mesocosm_Apr-Sept_otu_table_nochimera_FINAL.csv",
155
      "name": "ACER_mesocosm_Apr-Sept_otu_table_nochimera_FINAL.csv",
            
119
      "original_url": 
156
      "original_url": 
            
120
48ba3c/download/acer_mesocosm_apr-sept_otu_table_nochimera_final.csv",
157
48ba3c/download/acer_mesocosm_apr-sept_otu_table_nochimera_final.csv",
            
121
      "package_id": "d12b74af-4dbe-4fda-a5e8-61ba89063957",
158
      "package_id": "d12b74af-4dbe-4fda-a5e8-61ba89063957",
            
122
      "position": 1,
159
      "position": 1,
            
123
      "resource_id": "d8aadb4f-5217-466b-8fb4-2cce0348ba3c",
160
      "resource_id": "d8aadb4f-5217-466b-8fb4-2cce0348ba3c",
            
124
      "resource_type": null,
161
      "resource_type": null,
            
125
      "set_url_type": false,
162
      "set_url_type": false,
            
126
      "size": 400949,
163
      "size": 400949,
            
127
      "state": "active",
164
      "state": "active",
            
n
128
      "task_created": "2022-07-27 14:33:35.043009",
n
165
      "task_created": "2022-10-10 21:15:22.638652",
            
129
      "url": 
166
      "url": 
            
130
48ba3c/download/acer_mesocosm_apr-sept_otu_table_nochimera_final.csv",
167
48ba3c/download/acer_mesocosm_apr-sept_otu_table_nochimera_final.csv",
            
131
      "url_type": "upload"
168
      "url_type": "upload"
            
132
    },
169
    },
            
133
    {
170
    {
            
134
      "cache_last_updated": null,
171
      "cache_last_updated": null,
            
135
      "cache_url": null,
172
      "cache_url": null,
            
136
      "created": "2022-07-27T14:33:35.280901",
173
      "created": "2022-07-27T14:33:35.280901",
            
137
      "datastore_active": false,
174
      "datastore_active": false,
            
138
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
175
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
139
      "description": null,
176
      "description": null,
            
140
      "format": "TXT",
177
      "format": "TXT",
            
141
      "hash": "",
178
      "hash": "",
            
142
      "id": "a312a0ef-58c3-4355-98d9-072f4b0230cf",
179
      "id": "a312a0ef-58c3-4355-98d9-072f4b0230cf",
            
143
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:35.252390",
180
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:35.252390",
            
144
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:35:01.074993",
181
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:35:01.074993",
            
145
      "mimetype": "text/plain",
182
      "mimetype": "text/plain",
            
146
      "mimetype_inner": null,
183
      "mimetype_inner": null,
            
147
      "name": "metadata-GRIIDC.txt",
184
      "name": "metadata-GRIIDC.txt",
            
148
      "package_id": "d12b74af-4dbe-4fda-a5e8-61ba89063957",
185
      "package_id": "d12b74af-4dbe-4fda-a5e8-61ba89063957",
            
149
      "position": 2,
186
      "position": 2,
            
150
      "resource_type": null,
187
      "resource_type": null,
            
151
      "size": 6323,
188
      "size": 6323,
            
152
      "state": "active",
189
      "state": "active",
            
153
      "url": 
190
      "url": 
            
154
ce/a312a0ef-58c3-4355-98d9-072f4b0230cf/download/metadata-griidc.txt",
191
ce/a312a0ef-58c3-4355-98d9-072f4b0230cf/download/metadata-griidc.txt",
            
155
      "url_type": "upload"
192
      "url_type": "upload"
            
156
    }
193
    }
            
157
  ],
194
  ],
            
158
  "state": "active",
195
  "state": "active",
            
t
159
  "tags": [
t
196
  "tags": [],
            
160
    {

            
161
      "display_name": "biodiversity",

            
162
      "id": "16737851-e341-4f85-a496-dd82131afef6",

            
163
      "name": "biodiversity",

            
164
      "state": "active",

            
165
      "vocabulary_id": null

            
166
    },

            
167
    {

            
168
      "display_name": "microbial diversity",

            
169
      "id": "7bd6b977-facd-46c7-8489-5306f2cc0201",

            
170
      "name": "microbial diversity",

            
171
      "state": "active",

            
172
      "vocabulary_id": null

            
173
    },

            
174
    {

            
175
      "display_name": "nitrogen cycling",

            
176
      "id": "5dc58ca1-af9f-42fd-974a-8ab2649fe487",

            
177
      "name": "nitrogen cycling",

            
178
      "state": "active",

            
179
      "vocabulary_id": null

            
180
    },

            
181
    {

            
182
      "display_name": "oil contamination",

            
183
      "id": "c35d732a-94ad-4faa-9b67-4756918be772",

            
184
      "name": "oil contamination",

            
185
      "state": "active",

            
186
      "vocabulary_id": null

            
187
    },

            
188
    {

            
189
      "display_name": "sulfur cycling",

            
190
      "id": "4630ee57-ce5d-4cf2-a371-563194d5c624",

            
191
      "name": "sulfur cycling",

            
192
      "state": "active",

            
193
      "vocabulary_id": null

            
194
    }

            
195
  ],

            
196
  "title": "Temporal effects of oiling and plant type on microbial 
197
  "title": "Temporal effects of oiling and plant type on microbial 
            
197
biodiversity and predicted metabolic function in marine sediments: A 
198
biodiversity and predicted metabolic function in marine sediments: A 
            
198
mesocosm study in April/September 2016",
199
mesocosm study in April/September 2016",
            
199
  "type": "dataset",
200
  "type": "dataset",
            
200
  "url": null,
201
  "url": null,
            
201
  "version": null
202
  "version": null
            
202
}
203
}