Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Hidetoshi Urakawa",
2
  "author": "Hidetoshi Urakawa",
            
3
  "author_email": "hurakawa@fgcu.edu",
3
  "author_email": "hurakawa@fgcu.edu",
            
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
            
5
  "extras": [
5
  "extras": [
            
6
    {
6
    {
            
7
      "key": "DOI",
7
      "key": "DOI",
            
8
      "value": "doi:10.7266/FC0K9930"
8
      "value": "doi:10.7266/FC0K9930"
            
9
    },
9
    },
            
10
    {
10
    {
            
11
      "key": "ISO.pointOfContact",
11
      "key": "ISO.pointOfContact",
            
12
      "value": "Hidetoshi Urakawa <hurakawa@fgcu.edu>"
12
      "value": "Hidetoshi Urakawa <hurakawa@fgcu.edu>"
            
13
    },
13
    },
            
14
    {
14
    {
            
15
      "key": "Theme Keywords",
15
      "key": "Theme Keywords",
            
16
      "value": "Deepwater Horizon oil spill, seagrass, benthic algae, 
16
      "value": "Deepwater Horizon oil spill, seagrass, benthic algae, 
            
17
coastal, sediment, Eukarya, Cyanobacteria, 23S rRNA, oil exposure, 
17
coastal, sediment, Eukarya, Cyanobacteria, 23S rRNA, oil exposure, 
            
18
Ruppia maratima, Metagenomic, Mesocosm"
18
Ruppia maratima, Metagenomic, Mesocosm"
            
19
    }
19
    }
            
20
  ],
20
  ],
            
21
  "groups": [],
21
  "groups": [],
            
22
  "id": "5368ce9d-9901-44a3-b1f1-548666c755e5",
22
  "id": "5368ce9d-9901-44a3-b1f1-548666c755e5",
            
23
  "isopen": false,
23
  "isopen": false,
            
24
  "license_id": null,
24
  "license_id": null,
            
25
  "license_title": null,
25
  "license_title": null,
            
26
  "maintainer": "data@disl.org",
26
  "maintainer": "data@disl.org",
            
27
  "maintainer_email": "data@disl.org",
27
  "maintainer_email": "data@disl.org",
            
28
  "metadata_created": "2022-07-27T14:34:40.830000",
28
  "metadata_created": "2022-07-27T14:34:40.830000",
            
n
29
  "metadata_modified": "2022-07-27T14:38:14.532360",
n
29
  "metadata_modified": "2022-10-10T21:20:11.669920",
            
30
  "name": 
30
  "name": 
            
31
-simulated-oil-spill-seagrass-mesocosms-may-2016-to-septembefc0k9930",
31
-simulated-oil-spill-seagrass-mesocosms-may-2016-to-septembefc0k9930",
            
32
  "notes": "### Abstract\nThis data collection was generated from a 
32
  "notes": "### Abstract\nThis data collection was generated from a 
            
33
study in which oiled seagrass bed microcosms were created to examine 
33
study in which oiled seagrass bed microcosms were created to examine 
            
34
the oil spill responses on seagrass beds and benthic algal 
34
the oil spill responses on seagrass beds and benthic algal 
            
35
communities. Genomic DNA was extracted from the surface sediment cores 
35
communities. Genomic DNA was extracted from the surface sediment cores 
            
36
of 12 mesocosms. The abundance and biodiversity of microphytobenthic 
36
of 12 mesocosms. The abundance and biodiversity of microphytobenthic 
            
37
communities were characterized based on the 23S rRNA gene using 
37
communities were characterized based on the 23S rRNA gene using 
            
38
Illumina MiSeq 2x 250 bp technology. Sample information and DNA 
38
Illumina MiSeq 2x 250 bp technology. Sample information and DNA 
            
39
sequencing data can be accessed at the National Center for 
39
sequencing data can be accessed at the National Center for 
            
40
Biotechnology Information (NCBI) under accession number 
40
Biotechnology Information (NCBI) under accession number 
            
41
PRJNA630525.\n\n### Purpose\nShared research information and DNA 
41
PRJNA630525.\n\n### Purpose\nShared research information and DNA 
            
42
sequences can be used as references by other researchers who study 
42
sequences can be used as references by other researchers who study 
            
43
oiling effects on sulfate-reducing bacterial communities.\n\n**DOI: 
43
oiling effects on sulfate-reducing bacterial communities.\n\n**DOI: 
            
44
[doi:10.7266/FC0K9930](https://www.doi.org/10.7266/FC0K9930)**\n\n### 
44
[doi:10.7266/FC0K9930](https://www.doi.org/10.7266/FC0K9930)**\n\n### 
            
45
Suggested Citation\nTaylor L. Hancock and Hidetoshi Urakawa. 2020. 
45
Suggested Citation\nTaylor L. Hancock and Hidetoshi Urakawa. 2020. 
            
46
Microphytobenthic communities in simulated oil spill seagrass 
46
Microphytobenthic communities in simulated oil spill seagrass 
            
47
mesocosms, May 2016 to September 2016. Distributed by: Gulf of Mexico 
47
mesocosms, May 2016 to September 2016. Distributed by: Gulf of Mexico 
            
48
Research Initiative Information and Data Cooperative (GRIIDC), Harte 
48
Research Initiative Information and Data Cooperative (GRIIDC), Harte 
            
49
Research Institute, Texas A&M University\u2013Corpus Christi. 
49
Research Institute, Texas A&M University\u2013Corpus Christi. 
            
50
doi:10.7266/FC0K9930\n\n**Funded by:** Gulf of Mexico Research 
50
doi:10.7266/FC0K9930\n\n**Funded by:** Gulf of Mexico Research 
            
51
Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** RFP-IV\n\n**Research group:** 
51
Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** RFP-IV\n\n**Research group:** 
            
52
Alabama Center for Ecological Resilience (ACER)\n\n",
52
Alabama Center for Ecological Resilience (ACER)\n\n",
            
53
  "num_resources": 2,
53
  "num_resources": 2,
            
n
54
  "num_tags": 12,
n
54
  "num_tags": 0,
            
55
  "organization": {
55
  "organization": {
            
56
    "approval_status": "approved",
56
    "approval_status": "approved",
            
57
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
57
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
            
n
58
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
n
58
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab's (DISL) mission is to 
            
59
become a center for transformative U.S. oceanic and coastal research 
            
60
and education.. Founded in 1971 by the State of Alabama Legislature to 
            
61
maximize the marine sciences capabilities of several Alabama 
            
62
institutions and minimize duplication. \r\n\r\nLocated on the eastern 
            
63
tip of Dauphin Island, a barrier island in the northern Gulf of 
            
64
Mexico, DISL is surrounded by Mobile Bay, the Mississippi Sound, and 
            
65
the waters of the Gulf, making it a perfect location to conduct a wide 
            
66
range of marine science activity. \r\n\r\n[The University Programs 
            
67
(UP)](https://www.disl.edu/univ-prog/) serves the students of the 
            
68
Marine Environmental Sciences Consortium\u2019s (MESC) 22 public and 
            
69
private four-year colleges and universities through graduate and 
            
70
undergraduate programs. Throughout the year, graduate students conduct 
            
71
research, and attend classes while completing their degree under the 
            
72
mentorship of faculty and staff at the Dauphin Island Sea Lab.  
            
73
\r\n\r\n[The Discovery Hall Programs (DHP)](https://www.disl.edu/dhp/) 
            
74
oversees educational programs for K-12 field programs, 
            
75
teacher-training, and community outreach opportunities.  \r\n[The 
            
76
Estuarium](https://www.disl.edu/aquarium/), our public aquarium 
            
77
located on the Dauphin Island Sea Lab campus, is a part of DHP's 
            
78
educational outreach mission. The Estuarium focuses solely on the 
            
79
Mobile-Tensaw Estuary System. The BayMobile allows DHP educators to 
            
80
bring marine science to students across Alabama in the classroom and 
            
81
at community events. \r\n\r\nResearch programs at the Dauphin Island 
            
82
Sea Lab range from biogeochemistry and oceanography to ecosystem 
            
83
ecology. While much of our research focuses on the near-shore and 
            
84
estuarine processes of the northern Gulf of Mexico, field sites of our 
            
85
internationally-renowned faculty also include the Arctic, Mexico, 
            
86
Australia, and other countries.\r\n\r\nThe Dauphin Island Sea Lab also 
            
87
offers state and local government, industry, and agency 
            
88
decision-makers a range of coastal zone management services, including 
            
89
access to the nationally acclaimed data management center. Armed with 
            
90
data through the DISL data management center, entities can make 
            
91
well-informed decisions and sound policies while considering 
            
92
environmental impact. Another key contributor to successful coastal 
            
93
zone management is the Mobile Bay National Estuary Program, which 
            
94
falls within the services of DISL.\r\n\r\n",
            
59
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
95
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
n
60
    "image_url": "",
n
96
    "image_url": 
            
97
"2022-07-29-144848.512466DISL-centered-logo-w-Tag-CMYK.svg",
            
61
    "is_organization": true,
98
    "is_organization": true,
            
62
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
99
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
            
63
    "state": "active",
100
    "state": "active",
            
64
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
101
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
            
65
    "type": "organization"
102
    "type": "organization"
            
66
  },
103
  },
            
67
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
104
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
68
  "private": false,
105
  "private": false,
            
69
  "relationships_as_object": [],
106
  "relationships_as_object": [],
            
70
  "relationships_as_subject": [],
107
  "relationships_as_subject": [],
            
71
  "resources": [
108
  "resources": [
            
72
    {
109
    {
            
73
      "cache_last_updated": null,
110
      "cache_last_updated": null,
            
74
      "cache_url": null,
111
      "cache_url": null,
            
75
      "created": "2022-07-27T14:34:41.329003",
112
      "created": "2022-07-27T14:34:41.329003",
            
76
      "datastore_active": false,
113
      "datastore_active": false,
            
77
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
114
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
78
      "description": null,
115
      "description": null,
            
79
      "format": "XML",
116
      "format": "XML",
            
80
      "hash": "",
117
      "hash": "",
            
81
      "id": "7c355f16-d834-43f3-8726-204cdc3e771c",
118
      "id": "7c355f16-d834-43f3-8726-204cdc3e771c",
            
82
      "last_modified": "2022-07-27T14:34:41.254868",
119
      "last_modified": "2022-07-27T14:34:41.254868",
            
83
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:34:41.767390",
120
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:34:41.767390",
            
84
      "mimetype": "application/xml",
121
      "mimetype": "application/xml",
            
85
      "mimetype_inner": null,
122
      "mimetype_inner": null,
            
86
      "name": "R4.x262.000-0057-metadata.xml",
123
      "name": "R4.x262.000-0057-metadata.xml",
            
87
      "package_id": "5368ce9d-9901-44a3-b1f1-548666c755e5",
124
      "package_id": "5368ce9d-9901-44a3-b1f1-548666c755e5",
            
88
      "position": 0,
125
      "position": 0,
            
89
      "resource_type": null,
126
      "resource_type": null,
            
90
      "size": 25913,
127
      "size": 25913,
            
91
      "state": "active",
128
      "state": "active",
            
92
      "url": 
129
      "url": 
            
93
6-d834-43f3-8726-204cdc3e771c/download/r4.x262.000-0057-metadata.xml",
130
6-d834-43f3-8726-204cdc3e771c/download/r4.x262.000-0057-metadata.xml",
            
94
      "url_type": "upload"
131
      "url_type": "upload"
            
95
    },
132
    },
            
96
    {
133
    {
            
97
      "cache_last_updated": null,
134
      "cache_last_updated": null,
            
98
      "cache_url": null,
135
      "cache_url": null,
            
99
      "ckan_url": "https://data.disl.edu",
136
      "ckan_url": "https://data.disl.edu",
            
100
      "created": "2022-07-27T14:34:41.811526",
137
      "created": "2022-07-27T14:34:41.811526",
            
101
      "datastore_active": true,
138
      "datastore_active": true,
            
102
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": true,
139
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": true,
            
103
      "description": null,
140
      "description": null,
            
104
      "format": "CSV",
141
      "format": "CSV",
            
105
      "hash": "8ecdb96825e159406603861f77f93907",
142
      "hash": "8ecdb96825e159406603861f77f93907",
            
106
      "id": "3a1f8920-4d01-4e21-b2bb-9d64770c33e5",
143
      "id": "3a1f8920-4d01-4e21-b2bb-9d64770c33e5",
            
n
107
      "ignore_hash": false,
n
144
      "ignore_hash": true,
            
108
      "last_modified": "2022-07-27T14:34:41.747516",
145
      "last_modified": "2022-07-27T14:34:41.747516",
            
109
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:38:14.550434",
146
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:38:14.550434",
            
110
      "mimetype": "text/csv",
147
      "mimetype": "text/csv",
            
111
      "mimetype_inner": null,
148
      "mimetype_inner": null,
            
112
      "name": "PRJNA630525 Seagrass mesocosm.csv",
149
      "name": "PRJNA630525 Seagrass mesocosm.csv",
            
113
      "original_url": 
150
      "original_url": 
            
114
01-4e21-b2bb-9d64770c33e5/download/prjna630525-seagrass-mesocosm.csv",
151
01-4e21-b2bb-9d64770c33e5/download/prjna630525-seagrass-mesocosm.csv",
            
115
      "package_id": "5368ce9d-9901-44a3-b1f1-548666c755e5",
152
      "package_id": "5368ce9d-9901-44a3-b1f1-548666c755e5",
            
116
      "position": 1,
153
      "position": 1,
            
117
      "resource_id": "3a1f8920-4d01-4e21-b2bb-9d64770c33e5",
154
      "resource_id": "3a1f8920-4d01-4e21-b2bb-9d64770c33e5",
            
118
      "resource_type": null,
155
      "resource_type": null,
            
119
      "set_url_type": false,
156
      "set_url_type": false,
            
120
      "size": 8430,
157
      "size": 8430,
            
121
      "state": "active",
158
      "state": "active",
            
n
122
      "task_created": "2022-07-27 14:34:42.091905",
n
159
      "task_created": "2022-10-10 21:15:14.760568",
            
123
      "url": 
160
      "url": 
            
124
01-4e21-b2bb-9d64770c33e5/download/prjna630525-seagrass-mesocosm.csv",
161
01-4e21-b2bb-9d64770c33e5/download/prjna630525-seagrass-mesocosm.csv",
            
125
      "url_type": "upload"
162
      "url_type": "upload"
            
126
    }
163
    }
            
127
  ],
164
  ],
            
128
  "state": "active",
165
  "state": "active",
            
t
129
  "tags": [
t
166
  "tags": [],
            
130
    {

            
131
      "display_name": "23S rRNA",

            
132
      "id": "bd1819e5-e518-48df-b8f4-1f78d72e9474",

            
133
      "name": "23S rRNA",

            
134
      "state": "active",

            
135
      "vocabulary_id": null

            
136
    },

            
137
    {

            
138
      "display_name": "Cyanobacteria",

            
139
      "id": "e97d20ad-95d5-4882-985c-25f42f73733c",

            
140
      "name": "Cyanobacteria",

            
141
      "state": "active",

            
142
      "vocabulary_id": null

            
143
    },

            
144
    {

            
145
      "display_name": "Deepwater Horizon oil spill",

            
146
      "id": "3dba9434-7ecc-4aa5-a9f4-df31c3311b85",

            
147
      "name": "Deepwater Horizon oil spill",

            
148
      "state": "active",

            
149
      "vocabulary_id": null

            
150
    },

            
151
    {

            
152
      "display_name": "Eukarya",

            
153
      "id": "5a302a9d-2ca9-4c4f-bdb3-5f23c95eae17",

            
154
      "name": "Eukarya",

            
155
      "state": "active",

            
156
      "vocabulary_id": null

            
157
    },

            
158
    {

            
159
      "display_name": "Mesocosm",

            
160
      "id": "02ecac3b-9a6e-436c-af09-f24d467df00d",

            
161
      "name": "Mesocosm",

            
162
      "state": "active",

            
163
      "vocabulary_id": null

            
164
    },

            
165
    {

            
166
      "display_name": "Metagenomic",

            
167
      "id": "e78133f0-4cc7-44ef-8f8d-ee6a052a205b",

            
168
      "name": "Metagenomic",

            
169
      "state": "active",

            
170
      "vocabulary_id": null

            
171
    },

            
172
    {

            
173
      "display_name": "Ruppia maratima",

            
174
      "id": "3e45138b-cab3-4677-b6df-d2ac7e690c54",

            
175
      "name": "Ruppia maratima",

            
176
      "state": "active",

            
177
      "vocabulary_id": null

            
178
    },

            
179
    {

            
180
      "display_name": "benthic algae",

            
181
      "id": "39aa3a9a-231c-4d2f-ba76-2feb637bf2c8",

            
182
      "name": "benthic algae",

            
183
      "state": "active",

            
184
      "vocabulary_id": null

            
185
    },

            
186
    {

            
187
      "display_name": "coastal",

            
188
      "id": "ef936b5d-7d1f-40d2-b1e2-4608120a1274",

            
189
      "name": "coastal",

            
190
      "state": "active",

            
191
      "vocabulary_id": null

            
192
    },

            
193
    {

            
194
      "display_name": "oil exposure",

            
195
      "id": "2abd3941-14f8-4c75-ab64-e587ed7ff4d2",

            
196
      "name": "oil exposure",

            
197
      "state": "active",

            
198
      "vocabulary_id": null

            
199
    },

            
200
    {

            
201
      "display_name": "seagrass",

            
202
      "id": "5824ced6-3e9f-41c8-abac-b98bcff0e203",

            
203
      "name": "seagrass",

            
204
      "state": "active",

            
205
      "vocabulary_id": null

            
206
    },

            
207
    {

            
208
      "display_name": "sediment",

            
209
      "id": "d786ab28-d532-4342-a122-d99565e6d8ce",

            
210
      "name": "sediment",

            
211
      "state": "active",

            
212
      "vocabulary_id": null

            
213
    }

            
214
  ],

            
215
  "title": "Microphytobenthic communities in simulated oil spill 
167
  "title": "Microphytobenthic communities in simulated oil spill 
            
216
seagrass mesocosms, May 2016 to September 2016",
168
seagrass mesocosms, May 2016 to September 2016",
            
217
  "type": "dataset",
169
  "type": "dataset",
            
218
  "url": null,
170
  "url": null,
            
219
  "version": null
171
  "version": null
            
220
}
172
}